宏基因组学在病原体检测的优势与不足

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宏基因组学的狭义概念

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人类宏基因组学的概念

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宏基因组学在医学领域的应用案例

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宏基因组学在医学领域的应用案例（续）

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宏基因组学技术待解决的问题

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正在检索国内发表的关于宏基因组学方面的文献，发一些代表性的上来与大家分享

基于宏基因组学的猪群样本病毒探测方法的建立 韩文,罗玉子 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 微生物学报 2013/02

基于宏基因组学的猪群样本病毒探测方法的建立.pdf (1.28 MB, 下载次数: 2)

2013-5-1 21:42 上传

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宏基因组学及其在口腔微生物研究领域中的应用 陆剑,李宇红 口腔基础医学省部共建国家重点实验室培育基地和口腔生物医学教育部重点实验室武汉大学口腔医学院 国际口腔医学杂志 2013/01

宏基因组学研究特定生物环境中全部微小生物的基因组,直接从土壤和海水以及人体胃肠道和口腔等环境中获取样品DNA,利用适宜的载体将其克隆到替代宿主细胞中构建宏基因文库,以筛选新的活性物质和新的基因;因此,利用宏基因组学技术不仅能够有效地检测口腔微生物群落结构,同时还极大地扩展了口腔微生物资源的利用空间,增加了获得新的生物活性物质和基因的机会。本文就宏基因组学的研究方法和宏基因组学口腔微生物研究领域中的应用等研究进展作一综述。

宏基因组学及其在口腔微生物研究领域中的应用.pdf (277.57 KB, 下载次数: 2)

2013-5-1 21:43 上传

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宏基因组学在胃肠道微生物研究中的应用 吴莎莎,卢向阳 湖南农业大学生物科学技术学院 激光生物学报 2012/01

动物胃肠道中普遍存在大量共生微生物群,对于它们的研究一直受制于纯培养技术。随着分子生物学的快速发展及其在微生物学及生态学上的应用,针对未培养微生物研究的一门新型学科——宏基因组技术应运而生并迅速发展。通过提取胃肠道粘膜表面以及内容物中微生物DNA,构建总DNA文库的方法,利用基因组学的研究策略,来研究胃肠道中微生物遗传组成及群落功能。宏基因组技术在胃肠道微生物研究中广泛的应用,对于医学、生态学、生物能源利用等领域的研究具有重大的价值。


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2013-5-1 21:44 上传

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宏基因组学及在人体微生物研究上的应用 刘海燕,常玉梅 解放军二五二医院医务处中心实验室 中国现代医学杂志 2012/08

大量的人体微生物组成了一个微生物区系,其中大多数为非可培养微生物。宏基因组的方法即非培养基因分析法是近年来发展起来的新方法,可以有效地获知绝大多数人体微生物的基因多样性、种群结构及生态作用。在人体微生物研究中,宏基因组学可以用来发现新病原、抗性基因研究、疾病相关代谢研究和建立人体健康模型。

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宏基因组学技术的研究与挑战 周丹燕,戴世鲲 中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室广东省海洋药物重点实验室 微生物学通报 2011/04

宏基因组学研究作为研究微生物种群生态分布、群体遗传特征和基因相互作用的新兴学科领域,在很大程度上促进了环境微生物资源,特别是未培养微生物资源的开发利用,在土壤、海洋、人体医学、药物等各个领域的应用中取得了突破性的进展,为发现新的生物活性物质提供了新的有效途径。就宏基因组学研究进展进行综述,并重点介绍了宏基因组学研究中的机遇及挑战。

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2013-5-1 21:47 上传

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宏基因组与宏基因组学 孟飞,俞春娜 杭州师范大学生物医药与健康研究中心 中国生物化学与分子生物学报 2010/02

宏基因组学诞生于上世纪90年代,是指不经过微生物培养阶段,采用直接提取环境中总DNA的方法,对微生物基因总和进行研究的一门新学科.宏基因组技术的出现,使得人们对占微生物总体99%以上不可培养微生物的研究成为现实,微生物基因的可探测空间显著增大.总的来说,目前宏基因组技术的应用主要分为两个方面:一方面是筛选功能基因,开发具有所需功能的蛋白;另一方面是通过对宏基因组文库进行分析,探讨在各种环境下微生物间相互作用和微生物与周围环境间相互影响的规律,以便我们能更加客观、全面地认识微生物世界.在宏基因组技术的应用范围被不断扩展的同时,围绕着宏基因组文库的构建和筛选、测序和分析等方面的研究已成为宏基因组学发展的主要推动力,宏基因组技术的进步将不断提升其应用价值.

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2013-5-1 21:48 上传

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宏基因组学在发现新基因方面的应用 强慧妮,田宝玉 福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心 生物技术 2009/04

现代分子微生物生态学研究表明,自然环境中约99%的微生物不能用传统的分离培养方法获得其纯培养,使得环境微生物中的多样性基因资源难以得到充分的开发和应用。宏基因组学是近年来发展起来的,通过直接提取特定环境中全部微生物的总基因组DNA并克隆到合适的可培养微生物宿主中,来筛选目的基因的方法。它已在微生物新功能基因筛选、活性物质开发和微生物多样性研究等方面取得了显著成果。该文旨在介绍宏基因组学在新功能基因发现方面的应用概况并结合我们的研究情况,对这一崭新领域中的最近研究进展进行简要综述。


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2013-5-1 21:50 上传

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宏基因组学研究进展 黄循柳,黄仕杰 华南农业大学食品学院 微生物学通报 2009/07

不可培养微生物占据微生物总数的99%以上,这己成为微生物资源开发利用的一个限制性因素。宏基因组学是通过提取某一环境中的所有微生物基因组DNA、构建基因组文库及对文库进行筛选寻找和发现新的功能基因及活性代谢产物的一种方法。它避开了微生物分离培养的过程,极大地扩展了微生物资源的利用空间,是现代基因工程一个新的发展方向和研究热点。本文主要对宏基因组的DNA提取方法、文库的构建、筛选策略的选择及近年来宏基因组学在各领域中的应用研究现状进行了综述。


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宏基因组学及其在医学微生物学领域的应用 赵蓉,胡永峰 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所基因工程国家重点实验室 病毒学报 2009/03



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宏基因组学及其技术的研究进展 楚雍烈,杨娥 西安交通大学医学院免疫与病原生物系 西安交通大学学报(医学版) 2008/06

宏基因组学是研究生态群体基因功能和其相互作用的新科学领域,以特定生态环境中微小生物遗传物质的总和作为研究对象,基本研究策略是通过克隆、异源表达,筛选出有用的新基因及其产物。宏基因组学为生命学科和药学研究提供了一个强有力的新技术,并在包括医学在内的许多领域取得了新成就。本述评对宏基因组学的概念、技术和应用作了简要介绍。


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从宏基因组学切入探讨老年性阴道炎阴道微生态的微观整体性 曾倩,丁维俊 成都中医药大学附属医院 微生物学杂志 2008/02

老年性阴道炎是女性绝经后的常见病、多发病,西医认为该病的病因为绝经后或长期闭经后雌激素水平降低,阴道微生态失衡。宏基因组学是近年出现的菌群整体性检测方法,采用宏基因组学技术检测老年性阴道的微观整体状况,将为本病中医证型及疗效评定提供客观精确的量化标准。


从宏基因组学切入探讨老年性阴道炎阴道微生态的微观整体性.pdf (190.48 KB, 下载次数: 2)

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宏基因组学在未培养微生物研究中的应用 欧敏功,崔晓龙 云南大学教育部微生物资源开放研究重点实验室 微生物学杂志 2007/02

自然环境中约99%的微生物不能用传统的分离培养方法获得其纯培养。随着宏基因组技术的出现,人们可以对这一庞大的未知世界进行多方面的研究,包括微生物的生理、生态及其基因功能等。利用这一技术,研究者已经对地球上的许多生境进行了研究,并取得了很多新的成就。简要概述这一技术在研究未培养微生物方面的应用。


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再看近年来国际同行们对宏基因组学的关注：

1. 很明显，随时间发表的相关文献越来越多；

2. 主要的研究国家为美国、德国和中国，很高兴地发现中国学者很非常关注这个研究领域。

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这张柱状图更加清楚显示了不同时间发表的相关文献

星火

虽然不太清楚宏基因组学在目前的现状，但提供浏览，初步了解一点。
对近期报道的波士顿爆炸案里的二男子使用过的高压锅上有女人的基因，是否通过这个技术检测到呢？可能是机密。