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同源性分析技术专题之RFLP

   火...
发表于 2012-8-4 09:01:42 | 查看全部 |阅读模式 IP:江苏南京
月24日,我在超级细菌和多重耐药的版块讲解了PFGE技术,取得比较好的反响。
今天,利用休息,我继续讲解一下同源性分析技术中的RFLP技术。我觉得,同源性分析技术是医院感染暴发处理中的所需用到的重要技术,对于帮助我们判断是否为医院感染暴发起着重要作用。所以,今天把RFLP的技术介绍放到了医院感染暴发与处理版块。

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:03:45 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]什么是RFLP?
中、英文全称是什么?



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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:06:17 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]先来一个中文案例吧:
RFLP在布氏菌分型中的应用


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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:08:24 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]先看看这篇文章的实验方法,请关注RFLP的实验步骤。

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:10:37 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]再瞧瞧实验结果:
根据酶切结果将7 株菌株分成4 个基因型


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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:14:27 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]再看看基因序列的分析结果,你有没有什么发现?

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:21:11 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]再来一个英文案例:
PCR-RFLP在MRSA医院感染暴发流行病调查分子分型中的应用


MRSA在我国各大医院均非常常见,因此,建议大家仔细看看这篇RFLP在MRSA中的应用的文章。非常有借鉴意义!

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:26:23 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]看看实验方法:
提一个问题,为什么同时扩增三个基因并酶切分型呢?


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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:28:45 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]再看看RFLP的实验结果

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:30:39 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]这张表格更加清楚些,将RFLP与spa进行对比。

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:32:27 | 查看全部 IP:江苏南京
size=3]再看看本文的结论,肯定了RFLP技术在MRSA中的分型。


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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:35:48 | 查看全部 IP:江苏南京
本文作者又提到,该研究小组在数年前专门就RFLP技术用于MRSA分型技术发表了一篇方法学的文章。

下面让我们来看一看这篇文章,看看老外是如何来进行一个方法学研究的。
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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:37:32 | 查看全部 IP:江苏南京
先看一看菌株的来源

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:41:32 | 查看全部 IP:江苏南京
在这里,我详细列出了RFLP的实验细节,为什么呢?

因为我考虑到该技术成本低,只要一台常规的PCR仪,就可以完成分型的操作。必竟,考虑到我国的实际情况,在大多数医院开展PFGE这样的金标准技术,是不太现实的。因此,我向基层医院推荐RFLP,容易开展,同时采用多个基因酶切分型可以提高该技术的分辨能力。


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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:43:35 | 查看全部 IP:江苏南京
看看人家考虑的因素,对我们的研究是否有启发呢?
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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:45:54 | 查看全部 IP:江苏南京
看看A组菌株的分型对比,RFLP可以区分PFGE 14种型别中的10种,还算不错啊。
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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:47:19 | 查看全部 IP:江苏南京
B组的结果更佳呀,RFLP与RFLP的结果一致。

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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:49:15 | 查看全部 IP:江苏南京
再看看C组与D组的结果,RFLP与PFGE也是高度一致的结果啊。


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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:51:12 | 查看全部 IP:江苏南京
最后看看本文的结论。

另外,这些英文的用词和句式,是不是也值得我们学习与模仿呢?
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 楼主| 发表于 2012-8-4 09:53:28 | 查看全部 IP:江苏南京
上全文:PCR_RFLP技术在布氏菌鉴定与分型中的应用
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