产碳青酶烯酶大肠埃希菌的流行病学研究

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背 景：
抗生素耐药性是一个当前世界上普遍关注的问题，它既对当今患者的治疗提出了挑战，也对全球公共健康构成了日益增长的威胁。耐碳青霉烯类肠杆菌（CRE），如大肠埃希菌（Ec)，因其高水平的抗生素耐药性、当前有限的治疗手段以及通过动态的遗传因子广泛传播的潜力而特别令人担忧。
Ec是肠杆菌中引起的社区获得性感染中较为常见的一种，同时耐碳青霉烯类大肠埃希菌（CP-Ec) 也是全球因抗生素耐药性而引起死亡的重要病原体之一。最初，这一类的耐药菌往往被认为与医院获得性感染相关，但有越来越多的报道证明与住院无关的CP-Ec发病率在不断上升。 而CP-Ec中B类金属酶（MBL）的存在最令人担忧，因为针对产该酶分离株的治疗方法很有限。
因此研究者希望通过这篇报道来揭示CP-Ec的临床和分子流行病学特征以及转归，同时分析这些因素在产MBLCP-Ec和非产MBL CP-Ec之间的差异。 
实验设计：
实验纳入了2017年6月至2018年7月第一次培养出CP-Ec、同时全基因组测序（WGS）发现至少1个碳青霉烯酶基因的患者作为研究对象。随后记录患者的临床数据，包括患者人群特征、临床症状、实验室检查结果、接受的抗菌药物治疗和转归。同时研究者使用临床数据计算2个指数评分（皮特菌血症评分和查尔森共病指数）以捕捉疾病和共病的严重程度。最后研究者们对全部分离株进行了全基因组测序。

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研究共有194位患者分离到了CP-Ec，其中来自6个国家的26家医院的114（58%）位患者样本检测到了碳青霉烯酶基因。这些患者的中位年龄为60岁，其中一半为男性。大部分患者是社区获得性感染（(70%; 80/114），在中位数6天时分离陪养到CP-Ec。这些菌株最常见的来源是尿液（34%；39/114）和血液（21%，24/114）。其中43%的分离株（49/114）携带编码有一个MBL基因，另外57%（65/114）不携带MBL基因。分离株的地区分布差异明显（P < .0001)。携带MBL基因的Ec绝大部分来自于中国（23/24），不含MBL基因的分离株则多数来自于美国（21/25）、哥伦比亚（21/26）和新加坡（4/4），黎巴嫩则两种都有。一半的分离株（57/114）伴有符合感染定义的临床症状。相比而言，携带MBL基因的患者不符合感染标准的更多，同时在感染患者中，携带MBL基因的患者比不携带MBL基因的患者在首次陪养阳性时病情更轻。来自血液的分离株中非MBL-Ec占多数，而来自尿液的分离株中MBL-EC更多。

陈丽娜

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