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第二十六期 探秘病原微生物丨擦肩,但不能错过——谈厌氧培养的必要性

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发表于 2023-9-5 10:57:15 | 显示全部楼层 |阅读模式 IP:河南濮阳

《临床微生物学实验室建设基本要求专家共识》中明确提到厌氧菌培养需作为二级、三级医院实验室的必备技术,但实际上进行常规厌氧培养的实验室并未达到百分百,甚至比例较低。原因有多种,主要与厌氧培养的技术难、成本高有直接关系,但也与医务工作人员对厌氧培养的必要性认识不足有关。
不进行厌氧培养,我们会错过什么?首先,当然就是错过众多的厌氧菌。厌氧菌作为实验室众多培养菌中的“小众”,存在感并不强,但不代表其引起的临床感染少见、所致症状轻微。厌氧菌作为正常菌群定植在呼吸道、肠道等部位,但当人体免疫力低下、菌群紊乱、易位时可引起如血液、肺部、泌尿系、生殖道、腹腔等几乎所有部位的感染,一部分厌氧菌还与自闭症、抑郁症有关。厌氧菌引起菌血症的患者死亡率高达63%。临床感染常见的厌氧菌有脆弱拟杆菌群、普雷沃菌属、厌氧消化链球菌、产气荚膜梭菌、艰难梭菌等,病原谱与地区分布有关系,即不同地区分离的菌株分布可能存在差异。
其次,与厌氧菌的耐药监测擦肩而过。虽然甲硝唑、替硝唑等药物在抗厌氧菌感染方面应用广泛,但近些年已出现对这些药物耐药的菌株,尤其革兰阴性厌氧菌对抗厌氧菌药物的耐药性日益增加。美国一项为期8年的研究显示,从2012年至2019年,产气荚膜梭菌对克林霉素的敏感性由91.3%下降到60%,埃格特菌属对哌拉西林-他唑巴坦的敏感性由100%降至24.3%,脆弱拟杆菌群对头孢西丁的敏感性由70.4%降至48.2%,其中产气荚膜梭菌、脆弱拟杆菌均呈现对甲硝唑不同程度的耐药性。国内的一项研究发现,脆弱拟杆菌对甲硝唑的耐药率为7.1%,产气荚膜梭菌对青霉素及亚胺培南的耐药率分别达到57.7%、19.2%。虽然CLSI给出了常见厌氧菌的累积药物敏感性,对于临床经验治疗有一定参考价值,但不可否认的是,厌氧菌的药物敏感性同样存在地域差异,所以实验室开展厌氧菌药敏检测也是必要的。
第三,一些重要的兼性厌氧菌可能会“被”出局。厌氧培养有助于一些兼性厌氧菌的检出,包括提高培养阳性率、缩短阳性培养时间。尤其在血培养这个项目上,诸多研究发现厌氧血培养瓶的使用明显缩短培养瓶阳性报警时间。我们前期研究同样发现在1439套阳性血培养中,有15.3%的菌株仅在厌氧瓶内生长,即若不抽取厌氧瓶会漏检包括54株大肠埃希菌、23株肺炎克雷伯菌、13株金黄色葡萄球菌在内的158株兼性厌氧菌及62株严格厌氧菌。此外,所有厌氧瓶的阳性报警时间中位数时间比需氧瓶短1.1h,主要体现在大肠埃希菌、屎肠球菌,但金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌在厌氧瓶的报阳时间并不优于需氧瓶。除了血培养,临床常见的脓液标本也会体现厌氧培养的优越性,如肠杆菌目细菌在厌氧环境下较普通空气培养生长更好,链球菌更是如此(图1)。
此外,还涉及免疫受损患者的感染、复杂感染、多微生物感染等情况。这些感染中都有厌氧菌的身影。错过了它,不仅仅是医务工作者学习提高认知实践的遗憾,更可能是患者诊治的遗憾。
简单叙述了曾经的和即将的错过,遥望其他实验室能够检出的产气荚膜梭菌、艰难梭菌、脆弱拟杆菌等厌氧菌,大家有没有羡慕?如果想了解自己实验室的厌氧菌分布、耐药特征,自己医院的厌氧菌感染与治疗,就把厌氧培养技术操练起来吧!!
这里给大家留一个小问题?什么是耐氧试验?怎么做呢?
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图1 阑尾脓液培养
说明:
  • 左侧为厌氧布氏培养基(厌氧培养24h),生长大量口腔链球菌。
  • 右侧为普通血/中培养基(5%CO2培养24h),生长大量鲍曼不动杆菌。

延伸阅读:2011年日本专家在JIC增刊1上发表了系列厌氧菌文章,大家可以学习。
  • Japanese Society of Chemotherapy Committee on guidelines for treatment of anaerobic infections; Japanese Association for Anaerobic Infections Research. Chapter 1-1. Anaerobic infections (General): epidemiology of anaerobic infections. J Infect Chemother. 2011 Jul;17 Suppl 1:4-12. doi: 10.1007/s10156-010-0169-y. PMID: 21728084.
  • Japanese Society of Chemotherapy Committee on guidelines for treatment of anaerobic infections; Japanese Association for Anaerobic Infection Research. Chapter 2-1. Anaerobic infections (individual fields): respiratory infections. J Infect Chemother. 2011 Jul;17 Suppl 1:42-6. doi: 10.1007/s10156-010-0137-6. PMID: 21728090.
  • Japanese Society of Chemotherapy Committee on guidelines for treatment of anaerobic infections; Japanese Association for Anaerobic Infection Research. Chapter 3-1. Appendix: Latest classification and nomenclature for anaerobes. J Infect Chemother. 2011 Jul;17 Suppl 1:140-58. doi: 10.1007/s10156-010-0161-6. PMID: 21728114.

总共20多篇。有上面三篇,不难找到。编撰机构是,日本化学疗法学会厌氧感染治疗指南委员会,日本厌氧感染研究协会。
近期病例报道:
  • Morton AB, Boyle E, Pettengill MA, Gancher E. The Brief Case: Strictly Anaerobic and Staining Acid Fast. J Clin Microbiol. 2023 May 23;61(5):e0015022. doi: 10.1128/jcm.00150-22. Epub 2023 May 23. PMID: 37219093; PMCID: PMC10204630. 该文报道了劳森菌属菌种——克利夫兰劳森菌(Lawsonella clevelandensis)。全球病例较少。
  • Cyr AM, Perlman M, Denefrio CL, Kumar J, Sanders A. A Cryptic Case of an Anaerobic Hepatic Abscess Following a Cesarean Section. Cureus. 2023 Apr 8;15(4):e37293. doi: 10.7759/cureus.37293. PMID: 37168151; PMCID: PMC10166248.
  • Jiang Y, Qin W, Li J, Gao Y, Zeng Y. A case report of sepsis and death caused by Parvimonas micra, a rare anaerobe. Front Public Health. 2022 Sep 20;10:994279. doi: 10.3389/fpubh.2022.994279. PMID: 36203671; PMCID: PMC9530780. Parvimonas micra即微小小单胞菌。
  • Itoh N, Akazawa N, Ishibana Y, Hamada S, Hagiwara S, Murakami H. Femoral osteomyelitis caused by oral anaerobic bacteria with mixed bacteremia of Campylobacter rectus and Parvimonas micra in a chronic periodontitis patient: a case report. BMC Infect Dis. 2022 Jul 14;22(1):613. doi: 10.1186/s12879-022-07573-2. PMID: 35836203; PMCID: PMC9281128.
  • Tang Q, Ye B, Wang P, Ke L, Tong Z, Li W. Identification of Anaerobic Organism Infection in a Patient With Emphysematous Pancreatitis Based on Metagenomic Next-Generation Sequencing: A Case Report. Pancreas. 2022 May 1;51(5):e85-e87. doi: 10.1097/MPA.0000000000002060. PMID: 35973024.
  • Nakagawa Y, Otake S, Oue T, Ryu H, Kasai M. Case of infant invasive Streptococcus intermedius infection suggesting the need for anaerobic cultures. J Infect Chemother. 2022 Mar;28(3):437-439. doi: 10.1016/j.jiac.2021.11.002. Epub 2021 Nov 16. PMID: 34794869. 此例是通过厌氧培养检出,所以呼吁重视厌氧培养。
  • Li X, Du H, Song Z, Wang H, Long X. Polymicrobial Anaerobic Meningitis Detected by Next-Generation Sequencing: Case Report and Review of the Literature. Front Med (Lausanne). 2022 Feb 22;9:840910. doi: 10.3389/fmed.2022.840910. PMID: 35273982; PMCID: PMC8902384.



往期回顾:
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发表于 2023-9-8 11:48:30 | 显示全部楼层 IP:
老师帖下公众号链接,看起格式要好些,这个看起脑阔痛
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