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循证资讯之COVID-19 大流行对中国急性呼吸道感染的广泛影响:一项观察性研究

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发表于 2021-12-11 07:34 | 显示全部楼层 |阅读模式

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COVID-19 大流行对中国急性呼吸道感染的广泛影响:一项观察性研究
https://mp.weixin.qq.com/s/9HCommKMTDcFPDoLzW-kRA
[color=rgba(0, 0, 0, 0.3)]原创 陈建伟 SIFIC感染循证资讯2021-12-09 19:30

翻译:陈建伟 滨州医学院附属医院

一 研究背景

为抗击 COVID-19 大流行,世界各地实施了非药物干预措施 (NPI),如保持社交距离、戴口罩、在当地设立隔离所、旅行限制、学校关闭等,这对多数急性呼吸道感染 (ARI) 产生了影响。
本文利用中国 CDC 在全国范围内实施的呼吸道感染病原学监测 (SERI) 收集的独特数据,描述了中国大陆在 COVID-19 第一波疫情之前、期间和之后按年龄组和地区划分的 ARI 病毒的传播模式。


二 研究方法

(一)数据收集和流行病学描述
在 2012 年 1 月至 2021 年 1 月期间全国共 31 个省、314 家定点医院参与了 SERI 项目。对随机收集的 142559 ARI 病例治疗前鼻咽标本进行了 8 种病毒病原体检测,包括流感病毒 (IFV)、呼吸道合胞病毒 (RSV)、人副流感病毒 (HPIV)、人腺病毒 (hav)、人超肺病毒 (HMPV)、人冠状病毒 (HCoV)、人波卡病毒 (HBoV) 和人鼻病毒 (HRV)。
其中 IFV、RSV、HPIV、HMPV、HCoV 和 HRV 采用 RT-PCR 方法检测,Hav 和 HboV 采用 PCR 方法按照中国 CDC 制定的标准操作规程 (SOP) 检测。评估了中国在 COVID-19 大流行第一年与大流行前几年相比呼吸道感染的变化。
为说明 NPIs 对病原体传播模式的影响,根据中国防控 COVID-19 疫情重大干预事件的时间表,定义了三个时间段:
2020 年 1 月 23 日至 2020 年 4 月 7 日为第一阶段,武汉市处于封城状态;
2020 年 4 月 8 日至 8 月 31 日为第二阶段,全国范围内的新冠肺炎疫情得到缓解,学校仍继续关闭;
2020 年 9 月 1 日至 2021 年 1 月 22 日为第三阶段,大多数省份学校重新开放。
为与历史水平进行对照比较,根据大流行前年份 (2012 年 1 月 23 日至 2020 年 1 月 22 日) 的相应日历间隔确定了相同的时间段。然后比较大流行前年份的每个时间段的平均阳性检出率和大流行年相应时间段的阳性检出率。
(二)统计分析
月度阳性检出率用广义线性模型 (GLM) 绘制和拟合,量化不同时期 COVID-19 相关 NPIs 的实施对每种病毒的影响,按年龄分组 (0-17 岁和 ≥18 岁) 和地理区域 (中国南方和北方,图 1A) 分组。对月度数据重新定义为 I – III 期,分别对应 2 - 3 月、4 - 8 月和 9 - 1 月,假设每月的阳性病例数遵循二项分布。
NPIs 效应编码为 I - IV 阶段,分别对应 2012 年 1 月- 2020 年 1 月、2020 年 2 月- 2020 年 3 月、2020 年 4 月- 2020 年 8 月和 2020 年 9 月- 2021 年 1 月。
使用年周期和半年周期的正弦函数计算季节性 [22],日历年作为一个协变量体现长期趋势。
报告中指数回归系数为季节性调整的优势比 (OR),用 α = 5% 水平的双侧 p 值评估统计学意义。所有的统计分析都在 R 软件中进行 (版本 4.0.3, R 发展核心团队 2020)。


三 研究结果

(一)研究对象的总体变化
在纳入的 104652 ARI 例中从大流行前年平均检出 12108 例减少到大流行年的 7 783 例,见表 1 和图 1B;COVID-19 大流行期间,中位年龄从之前的 11 岁 (IQR: 2-45) 增加到 25 岁 (IQR: 3-53)。南北地域之间和男女两性之间没有定性差异。

(二)病毒阳性检出率的总体变化模式
与 2012 - 2019 年的平均水平相比,2020 年所有呼吸道病毒阳性检出率均有所下降,IFV 下降幅度最大,为-87.6%;RSV 下降幅度最小,为-17.2%,见表 1。急剧下降主要发生在 2 月至 8 月期间,尽管 HRV 在夏季反弹至历史水平,当时 NPIs 正在大规模实施,见图 2 和图 3。

尽管 IFV 和 HMPV 全年持续受到抑制,但 RSV、HPIV、HCoV、HRV HBov 在 2020 年 9 月至 2021 年 1 月期间再度上升并超过历史水平,这期间 NPIs 实施基本放松以及学校重新开学, 其中 RSV-A 和 RSV-B 在多年间呈现出明显的交替模式,表 1 和图 3。
此外,在大流行期间,同时感染 2 种或更多病毒的情况有所减少。
(三)病毒阳性检出率在人口统计学和临床亚组中的变化模式
在所有年龄组中,IFV、HPIV 和 HMPV 的阳性检出率从大流行年前到大流行年均显著下降;HRV、RSV 和 HBoV 的阳性检出率在成人 (≥18 岁) 中显著降低,而在儿童 (<18 岁) 中则无显著降低,特别是在中国北方地区死灰复燃更为明显 (图 1 A&#8722;C)。
在分析了每种病毒的季节性和长期趋势之后,这些观察结果仍然有效,见图 2 和图 3。男性和女性的变化模式基本一致 (图 2A); 除 IFV 和 HMPV 无区域差异外,其它病毒在中国北方阳性检出率高于南方,尤其 2020 年 9 月至 2021 年 1 月期间复苏明显,图 2B;HPIV 和 HCoV 的复苏更多与非肺炎患者相关,而 HBoV 的复苏更多与肺炎患者相关 (图 2C)。
(四)NPIs 对呼吸道病毒季节性和活动性的影响
对于在冬末、春初或初夏达到高峰的病毒而在 2020 年上半年被抑制或延迟,与大规模严格的 NPIs 实施相一致,NPIs 的 ORs 值均 <1(干预有效)。如 IFV、HAV、HMPV 和 RSV 的峰值被抑制或降低;在儿童中,HPIV 和 HBoV 的高峰被推迟到。
在 2020 年下半年,大多数病毒回到或超过历史水平,尤其在中国北方儿童中,这与 NPIs 实施放松以及学校重新开学相一致,此期间 NPIs 的 ORs 值均>1(干预无效)。


四 结论

在 COVID-19 大流行的早期阶段,呼吸道病毒感染活动大幅减少,大规模的 NPIs 的实施可能是主要驱动因素。取消 NPIs 可能会导致病毒感染卷土重来,特别是在儿童中。


五 讨论

大多数 ARI 病原体的传播和季节性流行在 2020 年 COVID-19 流行期间的第一阶段被抑制,与大规模的使用严格的 NPIs 有关。而在 2020 年下半年当大多数 NPIs 松懈、学校重新开学时,多数病毒迅速复苏,尤其是在儿童中,可能的原因是在控制期间易感因素的积累 [1]。
这些观察证实了学龄儿童在传播呼吸道感染方面的关键作用。许多病毒在中国北方的反弹比在中国南方更剧烈,提示为防止 COVID-19 卷土重来需要维持 NPIs 水平的必要性。
与大多数其他呼吸道病原体相比,流感病毒的活跃性在整个 COVID-19 大流行年始终低于历史水平,可能的原因是大流行期间国内和国际旅行大大减少,在交通枢纽仍然维持戴口罩和保持社交距离等 NPIs,这对预防主要通过飞沫和污染物传播的 ARI 非常有效。
呼吸道病毒之间的相互作用也可能发挥了作用,例如,HRV 感染被证明可以降低 IFV 感染的风险 [2-3]。流感疫苗不太可能是 IFV 传播减少的合理原因,因为在 COVID-19 大流行期间,中国的流感疫苗覆盖率显著降低 [4]。
尽管 COVID-19 大流行期间大多数病毒的总体传播减少,但其主要类型基本保持不变。多年来 RSV-A 和 RSV-B 之间的交替似乎也没有受到大流行的影响,IFV-A 和 HPIV-3 仍占其属的大部分,这可能是群体水平免疫谱促成的病毒特异性动态。
其次,COVID-19 大流行可能从本质上限制了 ARIs 患者的求医行为 [5]。
在未来的公共卫生突发事件中,在有效疫苗准备好之前,可将间断性的 NPIs 作为一线控制措施。在有可能或有必要取消 NPIs 时,需要制定策略,以保护儿童免受新出现的病原体和常见呼吸道病毒的侵害。
在 COVID-19 大流行期间,儿童是最后一个获得新疫苗的年龄组。其他呼吸道病毒感染,如流感可能使他们遭受严重的健康后果,应优先针对这些病毒性疾病进行疫苗接种和其他预防。
原文:Zhong-Jie Li, Lin-Jie Yu,Hai-Yang Zhang ,Chun-Xi Shan,Qing-Bin Lu , Xiao-Ai Zhang ,et al. Broad impacts of COVID-19 pandemic on acute respiratory infections in China: an observational study, Clin Infect Dis,  2021 Nov 12; ciab942. doi: 10.1093/cid/ciab942.
参考文献:Jones N. How COVID-19 is changing the cold and flu season. Nature 2020; 588:388-90.Wu A, Mihaylova VT, Landry ML, et al. Interference between rhinovirus and influenza A virus: a clinical data analysis and experimental infection study. Lancet Microbe 2020; 1:e254-e62.Nickbakhsh S, Mair C, Matthews L, et al. Virus-virus interactions impact the population dynamics of influenza and the common cold. Proc Natl Acad Sci U S A 2019; 116:27142-50.Hou Z, Song S, Du F, et al. The influence of the COVID-19 epidemic on prevention and vaccination behaviors among Chinese children and adolescents: cross-sectional online survey study. JMIR Public Health Surveill 2021; 7:e26372.Xiao H, Dai X, Wagenaar BH, et al. The impact of the COVID-19 pandemic on health services utilization in China: Time-series analyses for 2016–2020. Lancet Reg Health West Pac 2021; 9:100122.


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发表于 2021-12-11 08:37 | 显示全部楼层
谢谢小白老师分享!      
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发表于 2021-12-11 10:22 | 显示全部楼层
学习了,谢谢老师的分享。
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发表于 2021-12-11 10:49 | 显示全部楼层
感谢小白老师分享、学习啦
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发表于 2021-12-11 11:15 | 显示全部楼层
谢谢分享                                                      
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