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[转帖] 循证资讯之关于英国SARS-CoV-2 新变体流行的“灵魂7问

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发表于 2021-11-19 06:40:19 | 显示全部楼层 |阅读模式 IP:黑龙江黑河
本帖最后由 小白天使 于 2021-11-19 06:41 编辑

关于英国SARS-CoV-2 新变体流行的“灵魂7问”
https://mp.weixin.qq.com/s/kjKvarGJXADmUBgtxl2euQ
[color=rgba(0, 0, 0, 0.3)]原创莫明露SIFIC感染循证资讯2020-12-28
撰写:莫明露   四川射洪市中医院

导读:2020年的平安夜,我想大多数人(特别是疫情防控工作者)的微信朋友圈都出现过下面这张图——圣诞老人在从欧洲进入中国境内时核酸检测为阳性,已经被隔离了。#疫情防控人人有责#


(图片引自7维视点)圣诞老人不能“漂洋过海”来中国,其中最大的原因莫过于英国SARS-CoV-2新变体流行。
2020年12月19日,英国当局宣布,从20日起,伦敦、英格兰东南部和东部的防控将升至最高的四级。之后陆续40余个国家和地区暂停来自英国的航班入境。英国SARS-CoV-2新变体流行让人回想起了COVID-19初期的情景,当时世界上许多国家和地区,都禁止往返中国武汉。
那SARS-CoV-2新变体为何有如此大的“威力”?关于SARS-CoV-2新变体你想了解的下面都有:
01

新变体的出现?


2020年10月5日至12月13日,英格兰东南部COVID-19病例数突然上升,14天增加了3倍以上。截至2020年12月13日,英国共发现1108例SARS-CoV-2 VUI 202012/01感染病例。英国马上启动了一项流行病学和病毒学调查,并对英国SARS-CoV-2感染者中的5 -10%、英格兰东南部SARS-CoV-2感染者中的4%进行常规病毒基因测序。
通过研究发现:10月5日至12月13日,英格兰东南部超过50%的分离株被鉴定为该新变异株。回顾性研究发现,2020年9月20日在英格兰东南部的肯特郡发现了第一例新变体,随后在11月新变体病例迅速增加。这种新毒株感染病例大多发生在60岁以下的人群中。


02

新变种是否更具传染性?


答案已经很明确:是的。
根据对现有证据的分析,该新毒株(称为B.1.1.7或VUI 202012/01)传染力高于其他任何已发现的新变体,并且病毒载量也可能更高,估计传播力增加了40%至70%(基本传染数R0增加0.4,使其达到1.5至1.7的范围),也就是说一个感染者较之前会多传染给0.4个人。
虽然以前研究也发现了其他变种,但是并没有证据表明其改变了病毒的传染性,该新毒株出现后,在短时期内就造成了相对较高的发病率,说明它确实比其他变体更具有“选择性优势”,使得新毒株更容易人传人。在英国封锁措施实施期间,新毒株病例呈现指数性增长。目前,伦敦超过60%的新发病例都与新毒株有关。虽然传染力有所增加,但是导致疾病严重程度还需进一步调查,目前发现1000例患者中有4例死亡,与以往毒株造成的病死率持平。
03

此变体有哪些突变?


新变体出现了14个位点的突变,导致氨基酸变化和三个片段缺失,其中一些突变影响了病毒的传播力。其中最重要的一个突变是刺突蛋白中N501Y突变,该突变改变了受体结合域中六个关键残基的氨基酸。南非(n=45)和澳大利亚(n=37)也报道了相同的受体结合域突变(N501Y),但南非毒株和英国新毒株无关,只不过正好两者都有该突变。
新冠病毒刺突蛋白RBD位点的N501Y突变会提高病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力,而亲和力的提高则意味了实现同样程度的传染只需要更少的病毒量。另外一个具有生物学意义的突变是RBD位点上的P681H。此外,另一个重要的突变是69/70片段缺失,它会影响某些使用刺突基因为靶点的诊断性聚合酶链反应(PCR)反应。


04

新变体会影响疫苗效果吗?


新变体不太可能使疫苗失效。尽管新变体中存在的某些突变会影响抗体识别的某些位点,但由于新冠疫苗产生的抗体是针对刺突蛋白中的多个区域,所以新变体的单一位点突变不太可能使疫苗失效。但这一切也要经过试验才能知道。
05

新变体会更容易传染给儿童吗?



与非变异病毒相比,新变体会“更容易”传染给儿童。在11月英国封锁期间,“儿童感染病毒的分布发生了明显的改变。因为学校在封锁期间仍处于开放状态,在15岁以下的学生中,新变体病毒感染病例比非变异体病例略多,但不显著。文章也强调:并不是说这是一种专门攻击儿童的病毒,或者说其对儿童的感染力更强(只是调侃学校没有封锁,造成病毒更易在学校内传播)。
我们知道,SARS-CoV-2刚出现时,儿童发病率低于成人。关于原因,有许多假设,其中之一是ACE2受体在儿童中的表达可能不同。但是,如果把儿童置于“危险环境”中,更容易接触新的变种病毒,那当然儿童会更容易受到感染。


06

当前的PPE还可以起到保护作用吗?


鉴于新变种的传染性增加,是否需要新的个人防护装备?尽管这是我们医务人员最渴望、最想要知道的答案,但很遗憾其并未提及个人防护用品有效性方面的结论。但笔者相信,目前咱们医疗机构使用的外科口罩、医用防护口罩、隔离衣/防护服、防护眼罩/防护面屏等等肯定是有用的,毕竟传播方式并没有改变。所以,不必杞人忧天~

07

该变体是否已在蔓延?


新变种主要集中在英格兰的东南和东部,以及南威尔士和坎布里亚郡,但现在新变体在英国到处都有。包括澳大利亚、丹麦、意大利、冰岛和荷兰在内的一些国家已经发现了这种新变体病例,其他许多国家可能很快也会报告病例。超过40个国家已经停止了各种形式的往返英国的旅行,试图减少这种新变种的传播。


结语包括SARS-CoV-2在内的所有病毒都会随着时间发生变化,此次突变也许只是突变中的冰山一角。2020年12月23日,英国政府发布消息:在南非发现的可能更具传染性的第二种新变体(501.V2)已经在英国出现。该新变体表现出的传染力再次警醒着我们:“革命还未结束,同志仍需努力”,防控工作一定不能松懈。


最后附上WHO的一些建议:
  • 建议所有国家在可能的情况下,增加对SARS-CoV-2病毒的常规测序,并在国际上共享序列数据,特别是在发现相同的值得关注的突变时。
  • 注意针对病毒s基因的PCR检测性能下降的关注,实验室使用商用PCR试剂盒时,如制造商未在说明书中明确目标病毒基因,建议与制造商联系以明确。为了减少不同国家检测能力的影响,还建议使用针对不同病毒基因的多重分析方法来检测潜在的变异。
  • 所有国家都需要评估其当地传播水平,采取适当的预防和控制措施:避免与急性呼吸道感染患者密切接触;经常洗手,特别是在接触病人或环境后;有急性呼吸道感染症状者应遵守咳嗽礼仪(保持距离,咳嗽和打喷嚏时用一次性纸巾或衣物遮盖,并洗手);应戴口罩,确保空气流通;医疗机构加强标准预防措施。

参考文献
2.World Health Organization. SARS-CoV-2 variant—United Kingdom. 21 Dec 2020. https://www.who.int/csr/don/21-d ... -united-kingdom/en.
3.New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group. NERVTAG meeting on SARS-CoV-2 variant under investigation VUI-202012/01. 18 Dec 2020. https://khub.net/documents/13593 ... 96?t=1608491166921.
4.Rambaut A, Loman N, Pybus O, et al. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations. 18 Dec 2020. https://virological.org/t/prelim ... pike-mutations/563.
5.Tyler N. Starr, Allison J. Greaney, Sarah K. Hilton, et al. Deep Mutational Scanning of SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain Reveals Constraints on Folding and ACE2 Binding, Cell, Volume 182, Issue 5, 2020,Pages 1295-1310.e20,
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420310035
6.U.K. government confirms second strain of coronavirus,PUBLISHED WED, DEC 23 20205:26 PM ESTUPDATED WED, DEC 23 20205:59 PM EST
https://www.cnbc.com/2020/12/23/uk-government-confirms-second-strain-of-coronavirus.html?&qsearchterm=uk%20government




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发表于 2021-11-19 08:52:09 | 显示全部楼层 IP:重庆
学习了                                                                     
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发表于 2021-11-19 09:01:08 | 显示全部楼层 IP:浙江杭州
疫情防控、人人有责。目前的防控,需要全球的力量才是关键
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发表于 2021-11-19 10:00:10 | 显示全部楼层 IP:亚太地区
学习了谢谢老师的分享。
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发表于 2021-11-19 10:45:09 | 显示全部楼层 IP:福建厦门
学习了谢谢老师的分享。
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发表于 2021-11-19 11:05:37 | 显示全部楼层 IP:福建厦门
感谢老师分享,已下载学习。
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