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求助: 中东呼吸综合征冠状病毒实验室检测技术指南

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发表于 2020-1-21 18:49 | 显示全部楼层 |阅读模式

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发表于 2020-1-22 07:52 | 显示全部楼层
中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)实验室检测20150609 (1) - 豆丁网 http://snapshot.sogoucdn.com/web ... 00&m=0&st=1

中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)实验室检测技术指南 WHO:Laboratory Testing MiddleEast Respiratory Syndrome Coronavirus:interim recommendations (revised) (September2014 USCDC:Interim Guidelines Collecting,Handling, TestingClinical Specimens from Patients Under Investigation (PUIs) MiddleEast Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) 中东呼吸综合征冠状病毒感染疑似病例、临床诊断病例及需要进一步研究的确诊病例; 从事MERS-CoV检测标本采集的技术人员应经过生物安全培训,培训合格且具备相应的实验技能。在标本采集过 程中,采样人员进行安全防护。 住院病例的标本由所在医院医护人员在当地疾控机构专业人员指导下采集。 呼吸道(上、下呼吸道)和其他样品(血清、尿液和粪便)、尸检标本。 每个病例应尽可能同时采集上、下呼吸道标本,下呼吸道标本最佳,建议同时采集粪便和尿液标本。 应尽可能采取发病初期和恢复期双份血清标本以确定是否感染,双份血清样品间隔14~21天采集比较理想,第一份 血清应在发病第一周内采集。但单份样品的检测对于确定 疑似病例也有价值,如果只能采集一份样品,应该在出现 症状后至少14天采集。 标本的保存 若呼吸道样品72小时以上才能到达实验室,强烈推荐将样品储存在-80并使用干冰进行运输,应 避免样品反复冻融。 从全血分离的血清应4储存并运输,或用干冰、液氮冷冻并运输。由于无霜冰柜温度波动较大, 应避免使用无霜冰柜储存呼吸道和血清样品。 院内转运时,标本应该放置在耐用、防渗透的二级容器中进行转运。为减少任何标本破、漏的风险,不要使用任何气动传输系统 来转运任何可能疑似患者标本。 转运至CDC的MERS-CoV标本应该充分包裹,转运时不能开盖或分装标本。标本转运应该符合三重包装系统要求:内层是主要的 容器(一个可密封的标本袋缠绕以可吸收材料),第二层是防水、 防渗漏的容器,外层是用于转运的包装。 MERS-CoV感染标本包装和运输 MERS-CoV感染实验室检测方法 核酸检测:为目前早期诊断、早期发现MERS-CoV感染病例的主要检测方法,采用Real-time PCR 进行病毒核酸检测和诊断, 患者呼吸道样本中扩增到特异性核酸,可确诊MERS-CoV感染 利用假病毒进行中和抗体检测MERS-CoV的实验室检测靶标 目前病毒核酸的检测方法主要有:检测E蛋白上游基因(upE)、ORF1b、ORF1a 、N2基因四种。 这些方法均高度敏感,推荐upE检测用于初筛;检测ORF1b基因的方法不如针对ORF1a的方法敏感, 但比其更加特异;N2基因检测具有较高的灵敏性。 另外,已确定了中东呼吸综合征冠状病毒基因组中位于RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)和衣壳蛋 白(N)基因的几个适合测序验证的靶序列。 巢式PCR 普通PCR PCR产物电泳或测序 逆转录,获得cDNA 核酸提取 标本采集 PCR检测 荧光定量 PCR 待检样品upE 特异性RT-PCR检测 阳性 阴性 ORF1a RT-PCR检测 阳性 阴性 RdRp测序或N测序 阴性 抗原检测 抗体检测 病毒分离 阳性 实验流程 继续采样,如有必要应 送样至有MERS-CoV检 测经验的参比实验室进 行检测 入选病例 rRT-PCR upE基因进行筛查实验 阳性 阴性 rRT-PCR ORF1a、ORF1b或N基 因区进行确证实验 阴性,但如果临床和流行病学证据 充分,继续采样重复检测 阴性 阳性 RdRp或N区测序实验 阴性 显示为其 他序列 显示MERS-CoV 确诊病例 确诊病例
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发表于 2020-1-22 18:53 | 显示全部楼层
谢谢老师分享,学习了
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发表于 2021-12-27 15:43 | 显示全部楼层
学习学习,谢谢老师分享

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