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背景知识 宏基因组 学这一概念最早是在1998年由威斯康辛大学植物病理学部门的Jo Handelsman等提出的,是源于将来自环境中基因集可以在某种程度上当成一个单个基因组研究分析的想法,而宏的英文是“meta-”,具有更高层组织结构和动态变化的含义。后来伯克利分校的研究人员Kevin Chen和Lior Pachter将宏基因组定义为“应用现代基因组学的技术直接研究自然状态下的微生物的有机群落,而不需要在实验室中分离单一的菌株”的科学。 宏基因组学研究的对象是特定环境中的总DNA,不是某特定的微生物或其细胞中的总DNA,不需要对微生物进行分离培养和纯化,这对我们认识和利用95%以上的未培养微生物提供了一条新的途径。已有研究表明,利用宏基因组学对人体口腔微生物区系进行研究,发现了50多种新的细菌,这些未培养细菌很可能与口腔疾病有关。此外,在土壤、海洋和一些极端环境中也发现了许多新的微生物种群和新的基因或基因簇,通过克隆和筛选,获得了新的顺利活性物质,包括抗生素、酶以及新的药物等。 采用宏基因组技术及基因组测序等手段,来发现难培养或不可培养微生物中的天然产物以及处于“沉默”状态的天然产物。宏基因组不依赖于微生物的分离与培养,因而减少了由此带来的瓶颈问题。 乔-乔 2018.06.16第二届感染性疾病精准医学高峰论坛 华大基因 李永军博士做了“临床宏基因组学感染诊断:进展与前景”的精彩演讲,感谢李永军博士!
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