第二章 PUBMED简单检索技巧
一.在这一章里,我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献,作以简单介绍。
1.当你打开浏览器,在地址栏内键入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ 或是http://www.PubMed.gov/后,就进入
了PUBMED检索系统主页,可以见到如下的页面。
2.在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。
在检索框中输入查询词,然后单击"go"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。
说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符然后回车一敲便可万事大吉,其实不然。每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建议仅供读者参考:
• 明确你索要检索的关键概念及词语,即关键字;
• 考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;
• 通过限定DATES, STUDY GROUP等,精炼你的检索范围;
• 多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,都有可能形成不同的方法和技巧。
3.通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率
最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。
• AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某一处,就将其列出。
• 而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。
• NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时,除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章,同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。
4.PUBMED检索类型
通常我们所要查询的单词类型大致可以分为:
• 词语(主题)检索 这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词或短语(大写或小写均可)。然后回车或点击"Go", PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。例如:键入"vitamin c common cold"后回车或点击"Go", PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
• 著者检索 当我们所要查询的是著作者时, 在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为:"著者姓 空格 名字首字母缩写",例如smith ja,然后回车或点击Go,系统会自动到著者字段去检索,并显示检索结果。
• 刊名检索 在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号,例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524,然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。
• 日期或日期范围检索 可以在检索框中键入日期或日期范围,然后回车或点击Go,系统会按日期段检索,并将符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08
也可以不录月份和日子,如:2000或1999/12。
• 检索期刊子集(辑) 检索的格式为:检索词AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(有120种重要核心期刊)、Dental和Nursing。分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。
• 检索带文摘的记录 检索的格式为:检索词AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE记录中没有文摘。
• 布尔逻辑检索 PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(AND,OR或NOT)。具体使用时要注意的问题,详见上第3点所述。
5.如何处理检索结果
当你点击GO或回车后,PubMed将会自动运行检索命令,在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目,并且在查询框内保留原检索词。此时要注意的是符合检索要求的项目是以SUMMARY(简要格式)显示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一些信息。
在DISPLAY键后还可以选择别的显示格式,点击DISPLAY键后,系统按所选格式全部检索结果。
如果只需要显示其中一部分记录,则需点击该记录左边的查询框,使标记后,再点击Display键;如果只需显示一条记录,则可直接点击该记录中的作者姓名超链接,系统会自动显示该记录的文摘格式。
还有一点,系统所设定的默认值为每页显示20条选项,这点可以在SHOW后的下拉菜单处选择。
如果选中所感兴趣的内容,即可进行保存,打印等等操作。PubMed系统允许最多可保存5000条记录。要保存全部检索结果时,打开Summary下拉菜单选择其中一种格式,然后点击Save键;要保存特定记录时,点击记录左边的选择框予以标记后,再点击Save键。
使用浏览器的打印功能,即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式,请先点击Text键,然后再打印。
下一章我们将用几个实例来使大家熟悉以上检索技巧。
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