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编者按：孩子一发烧，家长心头焦。对于儿童肿瘤的患者，当怀疑其发生了菌血症时，能够快速、准确的做出微生物诊断，确定病原体及其耐药性，对临床治疗具有重要的意义。那么我们熟悉的PCR技术是否能够提供足够的帮助，能够更快更准的帮助临床做出微生物诊断呢？ 运用内部实时聚合酶链式反应（PCR）技术诊断儿科肿瘤患者的菌血症 背景：感染是儿童肿瘤患者常见的并发症和死亡的主要原因。这些患者能否获得一个良好的预后，取决于是否选择合适的治疗，这又取决于快速和准确的微生物诊断。本研究是对在巴西IOP-GRAACC-UNIFESP的儿科肿瘤研究所治疗的患者,采用实时荧光定量聚合酶链反应（qPCR）方法确定引起血流感染（BSI）的主要病原菌，同时运用这种方法对耐药基因进行了研究。 方法：从137例患者中分离到使用BACTECW血培养瓶的样本248个和使用EDTA K2凝胶管收集的血液样本99个。所有样品均通过多重实时荧光定量PCR（qPCR）特异性革兰氏探针筛选。使用特异性TaqMan探针评价十七个序列，采用SYBR Green法检测耐药基因blaSHV, blaTEM, blaCTX,blaKPC, blaIMP, blaSPM, blaVIM, vanA, vanB and mecA。 结果：有112瓶血培养结果为实时荧光定量PCR（qPCR）阳性（112 / 124），其中90%结果在表型和分子微生物检测方法之间是一致的。对细菌和真菌的鉴定的性能测试表明：与表型方法相比，敏感性87%，特异性91%，阴性预测值（NPV）90%，阳性预测值（PPV）89%，精确度89%。37个样品中检出甲氧西林耐药基因，6个样品中检出超广谱β内酰胺酶,4个样品中检出金属β-内酰胺酶的编码基因，这两种方法之间的一致性为60%。全血的实时荧光定量PCR（qPCR）检测出8例甲氧西林耐药基因和1例万古霉素耐药基因。该研究未检测到blaKPC、 blaVIM、blaIMP和blaSHV基因。 结论：实时荧光定量PCR方法是早期识别儿科肿瘤患者血流感染中病原菌和抗菌素耐药基因的一个有力工具。 关键词：实时荧光定量PCR，耐药基因，血流感染，细菌性病原体
文献检索者：陈文森 翻译者：万艳春 校对：乔甫
原文：Diagnosis of bacteremia in pediatric oncologic patientsby in-house real-time PCR. BMC Infect Dis. 2015 Jul 23;15:283. doi:0.1186/s12879-015-1033-6.
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