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甲型流感病毒如何漂洋过海来到中国?
此文章来源于www.cmt.com.cn
根据一项最新的研究成果,H7流感病毒株的许多谱系并不像过去认为的那样“泾渭分明”。通过一种追踪病毒株的新方法,研究人员演示了过去100年相关的流感基因网络如何突破大陆和海洋的边界而扩散。这项成果于近日发表在Cladistics杂志上。
甲型流感病毒H7亚型是高度致病性的,并多次感染人类。自1996年以来,H7病毒在美洲和欧洲已造成多次暴发。2013年初,H7N9禽流感病毒汹汹来袭,造成中国大陆、台湾和香港多人感染。
过去人们认为,H7病毒株有美洲和欧洲之分,而且这两种病毒株都不会跨过海洋。然而,北卡罗来纳大学的Daniel Janies不同意这种观点。“不仅仅是中国的H7N9,其他的我们认为不会发生在美洲的禽流感也正在发生,比如不列颠哥伦比亚省和太平洋西北部的暴发。”他是这篇文章的通讯作者。
Janies的团队搜索了国家生物技术信息中心的流感病毒资源数据库,收集了1902年以来的六大洲共41个国家的H7病毒株的基因片段。通过计算病毒基因组序列的进化树,并使用每种病毒的分离位置和日期的元数据,研究团队在Google Earth上绘制了路线路,显示了不同病毒株在全球范围内的旅行史。
Janies表示:“我们可以了解世界上的任何地方,病毒从哪儿来,病毒又会到哪儿去。此外,我们可以分析所有地方之间的关联,并对那些病原体的传播中枢地区进行排名。”
Janies认为,他们的方法能够为追踪其他疾病的迁移提供一个模型。目前,他与合作者已利用这种方法,确定印度是传播巴雷利沙门氏菌(Bareilly strain)的中枢。现在,Janies想要创建一个“疾病气象图”,形象地勾勒出疾病如何传播。
“我们已经接受了这样一种观念,如果飓风来了,我们会看它的新闻,提前做准备,”Janies说。“我认为我们也可以建立测序设备的网络,以便收集病原体及其性质的数据,每天晚上对其进行分析,并在每天早上建立一幅新地图,对疾病做好充分的准备。”
原文检索:
Daniel A. Janies, Laura W. Pomeroy, Chris Krueger, Yuqi Zhang, Izzet F. Senturk, Kamer Kaya andÜmit V. Çatalyürek. Phylogenetic visualization of the spread of H7 influenza A viruses. Cladistics. Jan 2015
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