马上注册登录，享用更多感控资源，助你轻松入门。
您需要 登录 才可以下载或查看，没有账号？注册
|
×
人类广泛存在新型肠道病毒
副标题：美发现人类广泛存在的新型肠道病毒
作者：张迪 来源：生物通 日期：2014-07-25
生活在我们肠道中的一种病毒，在过去几十年里从未被发现过，这本身就是件令人纳闷的事情。不过来自美国圣地亚哥州立大学的一组研究人员破解了这个奥秘，发现了存在于全世界半数人口以上的一种病毒，他们将其命名为crAssphage。crAssphage能感染一种最常见的肠道细菌Bacteroides，科学家们认为这种细菌认为与肥胖、糖尿病和其他内脏相关疾病有关。
这一研究成果公布在Nature Communications杂志上。
地亚哥州立大学的生物学家生物信息学教授Robert A. Edwards和他的同事偶然间获得了这一发现，他们与前访问学者（现在在Radboud大学）的Bas E. Dutilh合作，利用之前关于肠道病毒研究的结果，筛选出了一种新型病毒。
研究人员分析了12位不同个体的粪便样品DNA，发现了一种特殊的病毒DNA簇群，这一DN***段大约97,000个碱基对长，当Edwards和他的同事对照已知病毒列表寻找时，他们没有发现对应的病毒。
之后研究人员在美国国立卫生研究所人类微生物组项目 （HMP）数据库，以及阿贡国家实验室MG-RAST 数据中筛选占整个病毒，结果发现这种病毒在人类粪便中富集。
为了证明这种通过计算机数据发现的病毒DNA，实际上也存在于自然界中，研究人员采用了DNA扩增技术，在NIH数据库原始样品中定位病毒。
“因此我们也有生物证据，证明这种计算机中发现的病毒实际上也存在于样品中，”Mokili 说。
这是一种新的病毒，存在于许多人体内，但是我们却不知道。
Edwards说，“虽然找到一种新病毒并不出奇，但是这种病毒存在于很多人体内，而在如此多‘雷达’的监控下，这种病毒从未被发现，这就十分奇怪了。”
一种古老的病毒
这种病毒分布如此普遍，这表明它也许不是一个特别年轻的病毒。
“我们在几乎所有检查过的种群中都发现了这种病毒，就我们所知，这种病毒与人类出现的时间一样长，”Edwards 说。
研究人员将这种病毒命名为crAssphage，意思就是说他们是通过cross-assembly软件程序发现的这种病毒。
CrAssphage DNA中的一些蛋白质与其它早已被研究的一些病毒相似。因此Edwards研究组能确定这种新病毒是一种噬菌体，能在细菌里感染和复制，而且通过研究人员的创新生物信息学技术，他们也预测出这种特殊的噬菌体作用对象是一种常见的肠道细菌：Bacteriodetes。
关键字： crAssphage,肠道病毒,噬菌体
信源地址；http://infect.cmt.com.cn/detail/554063.html
|
发表于 2014-7-25 20:34
