DNA测序能切断超级细菌院内感染？

星火

导语：超级细菌的暴发困扰着英国剑桥市新生儿特殊护理病房的医护人员。在基因测序的帮助下，去年以来持续数月的困境终于结束了。刊登在近期出版的《柳叶刀—传染病》上的一份研究报告称，科学家首次测序了病原体基因，以便积极控制进行中的超级细菌暴发。

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超级细菌的暴发困扰着英国剑桥市新生儿特殊护理病房的医护人员。在基因测序的帮助下，去年以来持续数月的困境终于结束了。刊登在近期出版的《柳叶刀—传染病》上的一份研究报告称，科学家首次测序了病原体基因，以便积极控制进行中的超级细菌暴发。
　　英国剑桥大学的临床微生物学家Sharon Peacock及其同事被卷入了这场超级细菌暴发的困境中。当时，几天内，当地的罗西医院婴儿24小时特别监护室中的三个婴儿的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）测试相继呈阳性。
　　从这三个婴儿身上分离出的细菌对一类抗生素表现出耐药性，研究人员表示，这指向一个公共细菌源。病房被彻底地清扫干净，医护人员希望超级细菌噩梦能够就此结束。
　　不过，出于科学家的好奇心，Peacock研究小组继续调查了这三个病例是否与之前的半年里罗西医院出现的一系列MRSA感染有联系。
　　实验室测试结果显示，那时至少还有另外8名儿童感染了相似耐药性的MRSA菌株。但是，有数周没有出现感染病例，这又显示超级细菌的感染并不是简单地从该病房的婴儿传染到婴儿。
　　为了将一连串事件串联起来，Peacock研究小组开始对取自该医院的这种MRSA菌株以及收集自其他医院的成年患者的相似的菌株的基因进行测序。基因组测序结果显示，婴儿病房的菌株与其他疑似病例的菌株相吻合。
　　不过，罗西医院的细菌暴发并没有结束。该病房杀菌数天后，又有一个婴儿的MRSA检测结果呈阳性。
　　不断的MRSA传染，让Peacock和罗西医院流行病学家们如临大敌。确定暴发菌株基因序列后，他们开始从婴儿病房的154个工作人员中寻找暴发的菌株。其中一人的相关检测结果呈阳性，尽管还没有出现任何症状。
　　“我们将会将这个人隔离出感染链，以便有效地预防持续暴发。” Peacock说。
　　进一步的监查还在这些成年人之中发现了另外的传染病，这些人还包括从自己孩子身上接触过MRSA的父母。一共有14个患者——6个婴儿和8个****——出现严重感染，亟须治疗。最后一个确诊案例发生在大暴发一年之后，病人是一位父亲，他从配偶那里接触了MRSA。值得庆幸的是，没有人死亡。
　　这里，基因测序提供了明晰的线索，这是其他方法难以做到的，该论文的合作者、英国维康信托基金会桑格研究所微生物学家Julian Parkhill表示。
　　基因测序能够揭示细菌暴发过程中发生的一系列小规模的基因突变，帮助流行病学家编写一个进化树，并追踪暴发的源头。进化分析显示，这名受感染的雇员很可能是从该病房的一个患病婴儿那里感染了MRSA。
　　《中国科学报》 （2012-11-15 第2版 国际）

糖豆豆

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呵呵，挺不错的，来学习一下啊

星火

阴沟肠杆菌广泛存在于自然界中，是人和动物肠道内的正常菌群之一。近年来，随着广谱抗菌药物的广泛使用，阴沟肠杆菌的检出率及耐药性呈逐年升高趋势。同时，阴沟肠杆菌为机会致病菌，是院内感染的主要致病菌。曾有报道阴沟肠杆菌可阻遏AmpC酶和产超广谱β-内酰胺酶（extended spectrum beta-lactamases, ESBLs）的高表达，是导致该菌对β-内酰胺类抗菌药物耐药的主要机制。AmpC酶不能被克拉维酸、舒巴坦等抑制，其能水解一、二、三代头孢菌素，但对四代头孢菌素如头孢吡肟比较稳定。亚胺培南等碳青霉烯类抗菌药物对AmpC酶的作用相对稳定，因此多表现为敏感，这一结果与凌步致的研究报道一致。国外已有报道显示产KPC-2型碳青霉烯酶的菌株对亚胺培南低水平敏感。本院所分离的114株阴沟肠杆菌对碳青霉烯类抗菌药物均敏感，因此，亚胺培南等碳青霉烯类抗菌药物仍是治疗阴沟肠杆菌所引起严重感染的最好药物。本研究结果显示，所分离的阴沟肠杆菌对阿莫西林/棒酸的耐药率高达86.0%，所分离的阴沟肠杆菌对头孢唑啉、氨苄西林和头孢西丁的耐药率甚至高达100%，因此，以上抗菌药物不能用于治疗阴沟肠杆菌引起的感染。药敏结果显示，所分离的阴沟肠杆菌对头孢吡肟和妥布霉素的耐药率分别为39.5%和44.7%，对头孢他啶、氨曲南、头孢噻肟、复方新诺明和庆大霉素的耐药率均为50%以上，因此，临床上使用以上抗菌药物抗感染治疗时应对细菌的耐药性进行检测，以便及时更换敏感的抗菌药物，以防止治疗失败。本研究中阴沟肠杆菌对左氧氟沙星和环丙沙星的耐药率分别为29.8%和36.0%，由于喹诺酮类抗菌药物在临床抗感染治疗中已广泛使用，阴沟肠杆菌对喹诺酮类抗菌药物的耐药率有逐年升高的趋势。因此，临床上不能盲目的经验性使用喹诺酮类抗菌药物进行抗感染治疗，必须根据药敏结果合理选用敏感的抗菌药物。本研究中阴沟肠杆菌对哌拉西林/他唑巴坦的耐药率为8.8%，提示临床治疗阴沟肠杆菌引起的感染可首先选用哌拉西林/他唑巴坦；对阿米卡星的耐药率为23.7%，由于阿米卡星肾毒性等不良反应较大，临床使用时应慎重。本研究结果提示73.7%（84/114）的阴沟肠杆菌来源于痰液，说明本院阴沟肠杆菌引起的感染以呼吸道为主，与李莉等。的报道基本一致，所不同的是，本研究显示标本来源位居第2位的是胸腹水。

综上所述，近年来临床上阴沟肠杆菌的分离率逐年上升，临床中针对由阴沟肠杆菌所引起的感染治疗时，应及时掌握本地区近期阴沟肠杆菌的耐药特性，尤其注意使用抗菌药物前留取患者痰液等标本进行细菌培养和药敏试验，预防多重耐药菌株的产生，应引起临床医师的高度重视。