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[转帖] 新冠病毒家族“新秀”——Omicron BA.5丨我国已报道至少5起输入病例,如何科学应对?

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发表于 2022-7-13 08:23 | 显示全部楼层 |阅读模式

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新冠病毒家族“新秀”——Omicron BA.5丨我国已报道至少5起输入病例,如何科学应对?https://mp.weixin.qq.com/s/C3yL4SjN9rQ1Fssas6nAtA
[color=rgba(0, 0, 0, 0.3)]原创 SIFIC团队 SIFIC感染视界 2022-07-12 20:11 发表于广东
撰稿:陈文森(SIFIC-蓝鱼)

自2021年12月来,新冠病毒SARS-CoV-2 Omicron变异株迅速在全球流行并一直处于快速变异中。自早期检测到的Omicron B.1.1.529、BA.1、BA.2,南非豪登省地区测序又发现了两个新的亚系,BA.4 和BA.5,并快速在其他国家流行。

根据世界卫生组织最新报道,Omicron亚型BA.5已成为全球优势流行株,在我国香港、台湾、上海、北京和西安等多地均有输入疫情报道。美国斯克里普斯研究转化研究所所长埃里克·托波尔(Eric Topol)表示:“BA.5是我们迄今所见过的变异株中最糟糕的版本。它使已经广泛存在的免疫逃逸达到新的水平,并且增强了感染性,远远超出了我们此前所见到的奥密克戎变异株。”

为全面认识和科学应对Omicron BA.5,我们综述如下。


一、Omicron产生假说

2021年11月9日,南非首次检测到一种新冠病毒变异株。11月26日世卫组织将Omicron(B.1.1.529)分类为值得担忧的变异株(VOC)。现已知奥密克戎变异株谱系组成包括B.1.1.529、BA.1、BA.2、BA.3、BA.5和BA.5。Omicron是一种高度分化的变异株,具有大量刺突蛋白突变。复杂的突变模式平衡了受体结合能力(ACE2 结合)和免疫逃逸能力。

在人群中病毒传播和变异,进一步感染大量人群,在免疫功能低下的个体中,宿主对病毒的清除能力减弱,病毒会停留更长时间,从而导致更多突变的积累。病毒从受感染的个体传播给动物,异源免疫系统快速突变,可能感染健康人群,如果一个人感染了两种SARS-CoV-2突变株,就有重组的机会。因此Omicron获得了如此多的突变

图片来自于Environ Res 2022



二、Omicron 家族新秀 BA.5

受关注的 SARS-CoV-2 Omicron 变体的三个谱系(BA.1、BA.2 和 BA.3)主要推动了南非的第四次 COVID-19 浪潮。现已确定导致第五波感染的两个新谱系BA.4 和 BA.5。BA.4和BA.5的刺突蛋白是相同的,并且与BA.2相当,除了添加了69-70del(存在于Alpha变体和BA.1谱系中)、L452R(存在于Delta 变体中), F486V和Q493上的野生型氨基酸。在奥密克戎变异株的传播中,人们会看到不同的序列编号命名的变异体,例如BA.1、BA.2 和 BA.3、BA.4和BA.5等。这些变体之间是什么关系?是不是数字越大变异越多,传播力越厉害吗?

BA.5比BA.1具有更多的突变,但数字的改变与病毒感染力、传播力还不能完全划等号,且需进一步研究证实。基于现有证据,BA.5的传播力最强。如果以传染病的基本繁殖数 (R0) 来衡量疾病的传染性,在人们没有取得免疫力的情况下,早期传播的新冠祖先株R0值约为3.3,Delta变异株的R0值约为5.1,Omicron BA.1 R0值约为9.5,奥密克戎BA.2的R0值约为13.3。来自南非的预印本研究表明,BA.4/5的R0值可能达到18.6。这意味着该变异分支已经成为人类迄今为止传播率最快的病毒(原来的“老大哥”麻疹病毒R0值约为15)。


三、BA.5免疫逃逸能力

SARS-CoV-2 Omicron子变体BA.2.12.1和BA.4/5分别在美国和南非占据主导流行地位。与BA.2相比,BA.2.12.1 对来自接种疫苗和加强免疫个体的血清的抗性仅稍高(1.8倍)。然而,BA.4/5的抗性大大提高(4.2倍),因此更有可能导致疫苗突破性感染。SARS-CoV-2 的 Omicron 谱系继续进化,相继产生了不仅更易传播而且更能躲避抗体的亚变体。BA.4 和 BA.5 包含相同的刺突序列,虽然与BA.2密切相关,但它们在刺突的受体结合域中包含进一步的突变。与BA.1和 BA.2 相比,研究显示三剂阿斯利康或辉瑞疫苗对BA.4/5血清中和作用降低。此外,使用来自 BA.1疫苗突破性感染的血清,同样可以显示对BA.4/5的中和作用降低,意味着Omicron重复感染风险和可能。

(图片来自新英格兰医学N Engl J Med. 2022 Jul 7;387(1):86-88.doi: 10.1056/NEJMc2206576. Epub 2022 Jun 22.)


四、BA.5分支在全球流行情况

(一)全球流行情况:根据WHO 6月29日数据显示,Omicron变异株仍是全球新冠疫情中的主流毒株(序列报告占比94%),但变异分支BA.5上涨很快。
全球近7日流行情况,截至7月10日(图片来源于数据世界)

根据美国疾病预防控制中心(CDC)数据显示,BA.5目前占全美新增新冠病例的53.6%(见下图)。
数据来源于美国CDC

我国多地也报道BA.5输入病例:
  • 4月14日香港卫生署宣布,香港出现首例奥密克戎BA.5变异株感染者,为一名24岁由南非抵港男子。
  • 6月6日台湾新增4例奥密克戎亚型变异株BA.5确诊病例,分别为2例境外输入病例及2例本地病例,也是岛内首次出现变异株BA.5本地病例。
  • 7月8日上海浦东新区报告的1例社会面感染者感染的病毒为奥密克戎BA.5.2.1变异株,为境外入境关联感染者。
  • 7月2日0时至7月6日24时,西安市已累计报告本土感染者33例。基因测序显示,西安疫情的阳性感染者感染的毒株均为奥密克戎变异株BA.5.2分支。
  • 7月6日,北京的疫情发布会介绍,疾控部门对7月5日北京通报的感染者1至3的标本进行基因测序,结果显示病毒均属于BA.5.2分支。


五、BA.5临床预后是否更差

Davies MA等人研究比较了来自 BA.4/BA.5波的3,793名患者和来自先前波的 190,836 名患者严重住院/死亡风险,研究发现BA.4/BA.5和BA.1波的严重住院/死亡风险相似(调整后的风险比=1.12;95% 可信区间= 0.93-1.34)。与前几波相比,两波 Omicron 发生严重后果的风险较低。既往感染和疫苗接种具有保护性。他们认为在因先前感染和接种疫苗而对SARS-CoV-2的免疫力不断增强情况下,BA.4/BA.5和BA.1感染所致的新冠病例疾病严重程度相似。


六、世界卫生组织(WHO)最新报道

(一)疫情评估
  • 许多国家的检测数量大幅减少。这掩盖了病毒不断演变的真实情况以及全球 COVID-19 疾病的真实负担。这也意味着没有及早给予治疗以防止严重疾病和死亡。
  • 新的治疗方法,尤其是新型口服抗病毒药物,仍然没有到达低收入和中低收入国家。
  • 随着病毒的变异,疫苗保护——虽然在预防严重疾病和死亡方面仍然非常有效——确实减弱了。降低的免疫力也强调了加强接种的重要性,尤其是对于高危人群。
  • 每一波病毒都会使更多的人患上新冠病毒后的疾病,通常被称为长期新冠病毒。

(二)建议:
  • 为风险最大的人接种疫苗并加强免疫。这包括老年人、慢性病患者、免疫功能低下者和医务工作者。
  • 提供新的口服抗病毒药物和其他治疗方法。
  • 病例流行区域,采用公共卫生措施来降低风险,例如通风、口罩、保持社交距离,如果人们生病了,就呆在家里。
  • 加快下一代疫苗、检测和治疗的研发至关重要。


七、防控策略和建议

尽管新冠病毒一直在变异,但我们的防控策略,积累的防控经验及感控措施一直有效。现阶段,我国的防控策略是“外防输入、内放反弹”的总策略和精准防控动态清零总方针。从防控技术角度,非药物干预措施仍然是主要的防控手段 。除此之外,需要对老年人、慢性病患者、免疫功能低下者和医务工作者加强疫苗接种,在疫情应对中加强对脆弱人群的保护。

【参考文献】1.SARS-CoV-2 Omicron-B.1.1.529 leads to widespread escape from neutralizing antibody responses.[J] .Cell, 2022, 185: 467-484.e152.Khandia Rekha,Singhal Shailja,Alqahtani Taha et al. Emergence of SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529) variant, salient features, high global health concerns and strategies to counter it amid ongoing COVID-19 pandemic.[J] .Environ Res, 2022, 209: 112816.3.Tegally Houriiyah, Moir Monika,Everatt Josie et al. Emergence of SARS-CoV-2 Omicron lineages BA.4 and BA.5 in South Africa.[J] .Nat Med, 2022,4.Wang, Q., Guo, Y., Iketani, S. et al. Antibody evasion by SARS-CoV-2 Omicron subvariants BA.2.12.1, BA.4, & BA.5. Nature (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-022-05053-w5.Tuekprakhon Aekkachai,Nutalai Rungtiwa,Dijokaite-Guraliuc Aiste et al. Antibody escape of SARS-CoV-2 Omicron BA.4 and BA.5 from vaccine and BA.1 serum.[J] .Cell, 2022, 185: 2422-2433.e13.6.Davies Mary-Ann,Morden Erna,Rosseau Petro et al. Outcomes of laboratory-confirmed SARS-CoV-2 infection during resurgence driven by Omicron lineages BA.4 and BA.5 compared with previous waves in the Western Cape Province, South Africa.[J] .medRxiv, 2022, 10.1101/2022.06.28.222769837.WHO. https://www.who.int/director-gen ... 19-and-other-issues8.Non-pharmaceutical interventions, vaccination, and the SARS-CoV-2 delta variant in England: a mathematical modelling study.[J] .Lancet, 2021, 398: 1825-1835.9.Effectiveness of public health measures in reducing the incidence of covid-19, SARS-CoV-2 transmission, and covid-19 mortality: systematic review and meta-analysis.[J] .BMJ, 2021, 375: e068302.10.Drug treatments for covid-19: living systematic review and network meta-analysis.[J] .BMJ, 2020, 370: m2980.



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发表于 2022-7-13 09:16 | 显示全部楼层
严控外环,防止内环传播,防疫工作人人有责,单纯靠一个国家、一个省市、一个系统都是不能完成的!
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发表于 2022-7-13 12:31 | 显示全部楼层
了解学习了,谢谢老师的分享。
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发表于 2022-7-13 16:38 | 显示全部楼层
学习了,谢谢分享                                                                                   
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