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[原创] “超级真菌”背后的检测江湖

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发表于 2019-4-30 17:26 | 显示全部楼层 |阅读模式

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“超级真菌”背后的检测江湖
国内医疗机构真菌检验技术有待提升;企业纷纷布局质谱检测业务,质谱检测能否成为下一个基因测序?





“超级真菌”引爆A股市场毫无关联的抗菌概念股非理性上涨。事实上,发现超级真菌,微生物的鉴定检测技术和设备十分关键。基质辅助激光解析离子飞行质谱被认为是院内微生物鉴定检测的主流方向之一。图/美国疾病控制与预防中心官网







一个在美国的感染者死亡率达60%的“超级真菌”耳念珠菌在中国引发高度关注。但是很少有人知道,超级真菌是如何被查出来的。为何中国已知仅发现18例,而美国感染者数量众多?“超级真菌”引爆A股市场毫无关联的抗菌概念股非理性上涨(参见:“超级真菌”引爆抗菌概念股狂热非理性上涨何来?),与发现超级真菌真正有关的企业仍少有人知。



事实上,发现超级真菌,微生物的鉴定检测技术和设备十分关键。基质辅助激光解析离子飞行质谱(MALDI-TOF MS,以下简称质谱技术)被认为是院内微生物鉴定检测的主流方向之一。甚至此次“超级真菌”概念火热,也被少数业内人士认为有企业的推手,但此说未经证实。



相关各路企业早已开始布局质谱系统。据财新记者了解,目前国内市场仅有4家企业生产的微生物质谱鉴定系统获得国家药监局医疗器械注册证。



中国已知18例感染者中,15例在中国医科大学附属第一医院被发现。财新记者独家采访到接近该医院检验科人士,其向财新记者介绍了有关检验方法。据透露,患者临床标本被分离出35株“希木龙念珠菌(C.haemu-lonii )”,中国医科大学附属第一医院院长尚红及其团队对这35株菌株进行经再鉴定,后发现是耳念珠菌。尚红及其团队的检测手段中,也包括相应的质谱仪等设备。



质谱系统在国内市场前景如何?目前尚有不确定性。



该菌目前已在全球多个国家及地区传播,其中仅美国就有超过600例已知感染病例,死亡率达60%,但中国至今仅报道18例,且无死亡病例。(参见“中国已知18人感染“超级真菌”流行情况或被低估”)



国家卫生健康委抗菌药物临床应用和细菌耐药专家委员会办公室主任、北京协和医院检验科主任徐英春在接受媒体采访时提示,耳念珠菌在国内发生仍属个案,且耐药情况并不严重,能否称为“超级真菌”有待商榷。即使是在美国,出现的患者死亡案例不单纯是由于真菌感染导至,致病性也并未显著高于其他真菌。



如何检测超级真菌



超级真菌和普通真菌以及超级细菌都有差别,常规的实验室检测方法很难将其甄别。



耳念珠菌与此前多种念珠菌相似,容易诊断错误,其中最常被误判断为希木龙念珠菌,(Candida haemulonii)。目前国内发现最多感染者的中国医科大学附属第一医院中,患者临床标本最初也被认定分离出35株“希木龙念珠菌”。



中国工程院院士、第二军医大学长征医院皮肤科教授廖万清曾撰文指出,传统使用显微镜观察,耳念珠菌与其他念珠菌并无明显差别,“该菌的系统发育和表型与希木龙念珠菌接近……临床实验室可能将其误判为希木龙念珠菌或酿酒酵母菌(Saccharomyces cerevisiae),甚至直接报告为‘其他念珠菌’。”



全球多个国家都曾有耳念珠菌鉴定错误的报告。耳念珠菌最早于2009年被发现。当时,日本一家医院从一位女性患者的外耳道中分离出一株子囊真菌,被证实为一种新型的念珠菌,因此得名“耳念珠菌”。早在2009年日本首次报道发现该菌前,1996年,韩国就已分离出该真菌,但当时也错误将其鉴定为希木龙念珠菌。此外,印度、委内瑞拉、西班牙、哥伦比亚等地也都有类似报告。



超级真菌背后的质谱技术



基质辅助激光解析离子飞行质谱被认为是院内微生物鉴定检测的主流方向之一。



研究显示,MALDI-TOF MS是基于细菌表面蛋白分子检测的技术,通过测定未知微生物自身独特的蛋白质指纹图谱及特征性的图谱峰,并与数据库中参考菌株的蛋白指纹图谱进行比对,从而实现菌株鉴定。



2018年4月,美国FDA批准德国Bruker(布鲁克,纳斯达克:BRKR)公司开发的MALDI Biotyper CA 质谱系统作为首个鉴定耳念珠菌的方法,将耳念珠菌纳入系统数据库。



检出的耳念珠菌感染案例由此不断增加。当年5月,北京大学人民医院教授王辉和中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室研究员黄广华带领的团队通过时间飞行质谱和ITS测序鉴定,报道了中国首例耳念珠菌感染病例。但这一技术依靠丰富的质谱菌种鉴定数据库。由于国内发生耳念珠菌案例较少,国内企业虽有微生物鉴定检测业务布局,耳念珠菌鉴定能力有限。



国内医院普及率为何有限



多位学者在论文中指出,与传统鉴定方式相比,MALDI-TOF MS技术快速、准确、灵敏度和分辨率高,且对人员技能要求相对较低。



据财新记者了解,中国医科大学附属第一医院院长尚红在重新鉴定15名“希木龙念珠菌”感染者携带的菌株时,也采用质谱技术验证……



企业争相布局



“这个领域未来几年会非常热”,前述毅新博创始人兼董事长马庆伟预计,未来微生物质谱仪市场价格会降到100万以内。“未来市场规模有几千台没问题,甚至上万台都有可能。量上去了,价格才会下来。现在的量还是太少了。”
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发表于 2019-4-30 17:48 | 显示全部楼层
学习了,谢谢老师分享,
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发表于 2019-4-30 17:49 | 显示全部楼层
涨知识了,谢谢老师分享
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发表于 2019-5-1 17:11 | 显示全部楼层
谢谢分享!学到了不少知识!
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发表于 2019-5-1 20:06 | 显示全部楼层
学习了老师的资料分享!谢谢!
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