郑医感控前沿文献速递（1）

小猴子波波

• 内皮细胞-上皮细胞相互作用在COVID-19发病机制中的重要性：
  
  

Kenrie Pui-Yan Hui等研究发现尽管HPMVECs  （人肺微血管内皮细胞）不支持 SARS-CoV-2 的有效复制，但用从受感染气道细胞收集的条件培养基处理 HPMVECs 会诱导促炎细胞因子、趋化因子和血管粘附分子的上调，伊马替尼能抑制这些细胞因子、趋化因子和粘附分子的上调

• SARS-CoV-2与流感感染的不同炎性细胞因子特征与重症感染之间的关联：
  
  

Andrew H. Karaba等检测了135例COVID-19患者、57例流感患者和30例健康对照者的37种细胞因子和趋化因子，COVID-19与流感组的细胞因子和趋化因子增长情况不同， 在基于疾病严重程度的亚组分析中，IL-18、IL-6 和 TNF-α 在重症 COVID-19 中升高，但在重症流感中没有升高， 随机森林分析确定高 IL-6 和低 IFN-λ1 水平是严重 COVID-19 和严重流感之间最明显的区别， IL-1RA 被确定为 BMI 对 COVID-19 严重程度影响的潜在介质

1.CID,2022 Jan 29;74(2):199-209

2.CID,2022 Jan 29;74(2):254-262

• West Coast”变异株的流行与攻击：
  
  
  

James Peng等通过在旧金山的核酸快检站收集标本（双侧前鼻庭拭子）进行SARS-CoV-2基因组测序，共测序12124次，1099例阳性。“West Coast”检出率由11月的15.7%上升到1月份的54.4%。与“non-West Coast”家庭密接相比， “West Coast” (B.1.427 and B.1.429) 的家庭密接感染风险更高， “West Coast” 与“non-West Coast” 感染者的病毒载量相似

• COVID-2019持续和再感染的序列特征：
  
  
  Manish C Choudhary等评估了已发表的 SARS-CoV-2 的20例再感染与9例持续感染病例，再感染病毒基因组在很大程度上反映了该地理区域的同时期循环序列，而持续感染 主要在免疫抑制个体中被描述，并与病毒进化加速有关
  
  
• 新冠传播早于大规模核酸检测：
  
  

Evann E Hilt等将2019.11-2020.3（上旬）有呼吸道症状患者的呼吸道标本进行SARS-CoV-2检测，并对阳性标本进行测序。6名患者的7个标本中检出SARS-CoV-2，最早的阳性标本是2020.1.13采集的，该患者无相关的旅行史（有一个亲属有类似症状）。测序结果显示SARS-CoV-2早在1月份就已从国内或国际来源传入洛杉矶

• 再感染的流行病学
  
  

2019.12.1-2020.11.13期间美国62所医疗机构的9112名新冠患者，再感染率0.7%，两次阳性检测间隔116±21天，哮喘、尼古丁依赖/抽烟与再感染相关。再感染后肺炎、心力衰竭、急性肾损伤的发病率显著降低，2名二次感染患者死亡

1.CID,2022 Jan 7;74(1):32-39

2.CID,2022 Jan 29;74(2):237-245

3.CID,2022 Jan 29;74(2):271-277

4.CID,2022 Jan 29;74(2):294-300

• Bamlanivimab治疗新冠的疗效：
  
  

Rebecca N Kumar等进行了一项回顾性病例对照研究，2020.11.30-2021.1.19期间，218名新冠患者接受了Bamlanivimab治疗，185名新冠患者转诊并未接受药物治疗。接受Bamlanivimab治疗患者的30天住院率显著降低

• 新冠疫苗的作用：
  
  

Aaron J Tande等对2020.12.17-2021.2.8期间美国医保系统中术前SARS-CoV-2筛查的39156名患者（48333次）进行一项回顾性队列研究，接种疫苗比未接种的无症状感染者检出率显著降低（1.4%:3.2%,RR=0.44;95%CL,0.33-0.60;P＜0.001），首诊接种后＞10天和第二针接种后＞0天的患者中无症状感染者检出率较低

• 新冠流行期间抗呼吸道感染相关处方药使用率增加：
  
  

Katryna A Gouin等分析了2020年1-10月1944 US NHs数据库中抗生素与COVID-2019治疗药物（羟氯喹、法莫替丁和地塞米松）的处方趋势。2020 年 4 月，NHs 中用于 COVID-19 治疗药物的处方明显高于 2019 年，包括羟氯喹 (+563%, 95% CI: 5.87, 7.48) 、阿奇霉素(+150%, 95% CI:2.37,2.63)和头孢曲松（+43%,95% CI:1.34,1.54）。4月份地塞米松的处方量减少了 36%（95% CI:0.55,0.73），7 月份增加了 303%（95% CI:3.66,4.45）。尽管阿奇霉素和头孢曲松的处方有所增加，但 2020 年 5 月（-5%，95% CI:0.94,0.97）到 10 月（-4%,95% CI:0.94，0.97），居民的总抗生素处方量低于2019 年

• 新冠感染（重症型）的中期预后：
  
  

Nandan Gautam等回顾性观察了3所医院的200名重症COVID-19患者，很大一部分 COVID-19重症患者在发病 4-7 个月后仍会出现呼吸困难、疲劳、疼痛、行动不便、抑郁和生活质量下降等症状， 有呼吸困难患者的胸片和 肺功能检查异常会遗留

1.CID,2022 Jan 29;74(1):24-31

2.CID,2022 Jan 29;74(1):59-65

3.CID,2022 Jan 29;74(1):74-82

4.CID,2022 Jan 29;74(2):301-308

• 新冠机械通气患者的肺曲霉菌病：
  
  

Nitipong Permpalung等对2020 年 3-8 月期间约翰霍普金斯大学 5 家医院收治的 COVID-19成人机械通气患者进行了一项回顾性队列研究。在 396 人的队列中，39 人符合 CAPA 标准。CAPA 患者比非 CAPA 的患者相比更可能患有潜在的肺血管疾病、肝脏疾病、凝血障碍、实体瘤、多发性骨髓瘤，在入院时有皮质类固醇暴露和较低的体重指数。CAPA 患者的预后更差，需要更长的时间改善临床症状，严重程度的进展速度几乎是两倍，插管时间是非CAPA 的两倍，住院时间更长

• SARS-CoV-2 RNAemia：
  
  

Nikhil Ram-Mohan等使用qPCR 和 dPCR对 191 名因 COVID-19 到急诊科就诊的患者血浆中的 SARS-CoV-2 RNA 进行定量。dPCR 在检测 SARS-CoV-2 RNAemia方面比 qPCR 更敏感，是 COVID-19 严重程度和氧气需求以及 EPC 的有力预测指标。

• Long Coronavirus Disease症状和影响的评估工具：
  
  

Viet-Thi Tran等根据429名长时间感染COVID-19患者（确诊且症状持续3周以上的成年人）的开放式问卷的答案构建评估工具，1022名长时间感染COVID-19患者验证

• 肯尼亚医务人员血清抗体阳性率：
  
  

Anthony O Etyang等调查了来自肯尼亚不同地域医务人员血清SARS-CoV-2抗体，血清阳性率为19.7%，调整检测阈值后阳性率为20.8%，不同地域血清阳性率存在显著差异，Nairobi＞ Busia＞ Kilifi

1.CID,2022 Jan 29;74(1):83-91

2.CID,2022 Jan 29;74(2):218-226

3.CID,2022 Jan 29;74(2):278-287

4.CID,2022 Jan 29;74(2):288-293

• 家庭二次感染发生率：
  
  

Daphne F M Reukers等分析了2020.3-5期间荷兰的55个阳性病例家庭187名家庭接触者，其中17个家庭中未发生传播，11个家庭的所有接触者均感染。家庭二次感染率高于早期报道，与青少年和成年人相比，儿童的的易感性降低

• 家庭暴露与SARS-CoV-2重症感染之间的关联：
  
  

2022.2.22-10.6期间丹麦的一项全国范围性队列研究结果显示，15 063 个多人家庭中包括19 773 名 SARS-CoV-2阳性个体，SARS-CoV-2阳性病例家庭接触者的重症感染风险比未增高

• 严格执行防控措施学校的新冠发生率低于社区传播力：
  
  

IolandaJordan等在2020 年 7 月前瞻性地招募了在巴西巴塞罗那暑期学校的SARS-CoV-2儿童和成人工作人员感染者（22个暑期学校1905名参与者），所有学校都遵循统一的预防方案：bubble groups、洗手、戴口罩以及大部分户外活动。30 名儿童和 9 名成人被确定为原发病例，其253 名密切接触者中 12 例为SARS-CoV-2 阳性新病例。在严格的预防措施下，就读于学校儿童中 SARS-CoV-2的传播率低于同社区一般人群报告的传播率

• K12阶段学生线下上课与新冠传播的关联:
  
  

Gabriel T Bosslet等观察了 2020.7.12-10.6期间印第安纳州 92 个县中的 73 个（占全州学校的 85.7% 和学生入学率的 90.6%）新冠传播情况，K12阶段学生线下上课与该地区28天后每县日SARS-CoV-2发病率存在显著关联，如K12线下上课的学生阳性率增加10%，该地区每日增加0.336例/10万所有年龄段的居民

• 新冠在美国学区的传播：
  
  

Jenna R Gettings等观察了2020.12.1-2021.1.22期间的86例病例1119里学校接触者，室内运动、职工会议/就餐、教室为高感染风险点

1.CID,2022 Jan 29;74(1):95-104

2.CID,2022 Jan 29;74(2):171-179

3.CID,2022 Jan 29;74(2):210-217

4.CID,2022 Jan 29;74(2):227-236

5.CID,2022 Jan 29;74(1):113-119

                               
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• Ruxolitinib治疗HIV的疗效：
  
  

Vincent C Marconi等组织了一项开放式、多中心、随机对照试验，2016.5.16-2018.1.10招募了60名接受抗逆转录病毒治疗的成年HIV患者，疗效方面Ruxolitinib显著降低了免疫激活和细胞存活的标志物，安全性方面与对照组无差异

• 抗逆转录病毒疗法失访HIV者的结局：
  
  

追踪了2014-2017年南非ART项目中失访的HIV患者，共3256名（1323名失访）患者，共追踪2294名，其中768名（34%）正接受治疗并生存，385名（17%）转至其他诊所治疗，528名（23%）未接受治疗/不明治疗但存活，252名（11%）死亡。男性死亡率高于女性，儿童死亡率高于成年人，接受ART＜1年或失访≥1年及居住在偏远地带的失访者死亡率更高

• HBV普筛的成本效益：
  
  

Mehlika Toy等通过一种算法分析18-69岁成年人HBV普遍筛查的成本效益，与目前的做法相比，普遍筛查将额外避免 7.4 例代偿期肝硬化、3.3 例失代偿期肝硬化、5.5 例肝细胞癌、1.9 例肝移植和 10.3 例乙型肝炎病毒相关死亡，每100 000 人节省 263 000美元

• 非洲和东南亚地区流感高危人群的疫苗接种可行性分析：
  
  

流感疫苗接种对象为<5 岁、孕妇、慢性病患者、≥65 岁和医护人员，在基础设施和资源有限的国家，大多数风险群体的流感疫苗接种将需要大幅增加剂量、每个接种者的剂量和冷藏能力

• 护理院中诺如病毒暴发：
  
  

Laura E Calderwood等将两个数据库中记录的2009-2018年美国护理院中诺如病毒暴发分析，十年间全美共报道了13092起诺如病毒暴发事件416284例，75%发生在12月-3月,居住者发病率高于工作人员，每1000例居住者中21.6人因诺如病毒住院、2.3人死亡

1.CID,2022 Jan 29;74(1):95-104

2.CID,2022 Jan 29;74(2):171-179

3.CID,2022 Jan 29;74(2):210-217

4.CID,2022 Jan 29;74(2):227-236

5.CID,2022 Jan 29;74(1):113-119

                               
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• 吸毒人群感染金葡的情况：
  
  

2013-2018年旧金山的2个医疗中心共收治因SA感染而住院的946例患者（963次），372人（39%）为吸毒者。相对于非吸毒者，吸毒者抗菌药物完成率更低，持续或复发再入院率是非吸毒者的2倍，MRSA与1年感染再入院独立相关

• 对万古霉素敏感性低的CD在患者中传播：
  
  

分别采集了438名休斯顿和98名内罗毕的CDI患者大便标本，休斯顿CDI患者粪便样本中，对万古霉素不敏感的114/438 (26%) ，对甲硝唑不敏感的128/438 (29%) 。内罗毕的CDI患者中有 66 名 (67%) 和 83/98 (85%) 分别携带万古霉素和甲硝唑不敏感的分离株。用万古霉素治疗接种这些菌种的小鼠，未能根治

• 新生儿李斯特菌病的临床表现和结局：
  
  

2009.11-2017.12登记的经微生物学证实为李斯特菌病母亲的新生儿189例，其中133例（70%）新生儿出生时状态异常，106例急性呼吸窘迫，132例早发李斯特菌病、12例晚发李斯特菌病，均表现为脑膜炎；17例出现严重不良反应：5例死亡、12例严重脑损伤、3例严重支气管肺发育不良；产妇在分娩前 1 天接受抗菌药物治疗与婴儿临床表现严重程度降低显着相关，正性肌力药物、液体复苏和机械通气需求显着减少

• 百日咳母体抗体与新生儿免疫：
  
  

母亲孕期接种疫苗的新生儿脐带血抗体浓度显著高于未接种的，母亲接种疫苗与分娩时间越长，脐带血抗体浓度越高

1.CID,2022 Jan 29;74(2):263-270

2.CID,2022 Jan 29;74(1):120-126

3.CID,2022 Jan 29;74(1):8-16

4.CID,2022 Jan 29;74(2):189-198

• 1999-2018美国侵袭性真菌病的死亡率：
  
  

近期美国侵袭性真菌病发病数量在上升，且易感人群由HIV患者转换为癌症、败血症、免疫抑制疾病和流感患者等新免疫功能低下人群

• 青蒿琥酯在无症状疟疾感染者中的疗效、安全性和耐受性（RCT）：
  
  

2期药物临床试验（开放式、多中心）， PA 在无症状的恶性疟原虫感染个体中具有高疗效和良好的耐受性，完整的 3 -day和不完整的2 -day方案具有相似的疗效

• 疟疾的诊断标记物（文献的二次分析）：
  
  

检索复杂性疟疾诊断生物标记物文献，对有利诊断特征的疟原虫蛋白质组学数据进行再次分析，发现了2种新型疟疾诊断生物标记物

1.CID,2022 Jan 29;74(2):309-318

2.CID,2022 Jan 29;74(2):180-188

3.CID,2022 Jan 29;74(1):8-16

4.CID,2022 Jan 29;74(1):40-51

                               
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• 抗菌药物与微生物检出：
  
  

2017.10 -2018.9，纳入332 657患者的 482 381 次住院治疗，202 037 人（41.9%）住院时间至少使用了 1 种抗菌药物。130 012 (64.4%) 例使用任何抗生素的住院病例中采集了标本，其中35.1%的住院病例中至少分离出了 1 种病原菌。病原菌分离频率因诊断类别和抗菌药物而异，974 733个抗生素治疗日中有10.2%-31.4%可能与潜在的病原体有关

• 经期中毒性休克综合征：
  
  

2005.1.1-2020.12.31期间法国 43 个儿科 (n = 7) 或成人 (n = 36) ICU 收治的临床诊断为 m-TSS的患者进行的回顾性队列研究。共 102例m-TSS 患者，血培养均为阴性，96个阴道标本中92个检出MSSA，其中76个进行了毒素基因序列监测，66个检测出toxic shock syndrome toxin 1。无人截肢或死亡。入院时无人符合2011年CDC诊断标准，53名符合疑似标准（CDC 标准不适用于m-TSS 入院诊断 ）

1.CID,2022 Jan 29;74(1):105-112

2.CID,2022 Jan 29;74(2):180-188

3.CID,2022 Jan 29;74(1):8-16

4.CID,2022 Jan 29;74(1):40-51

                               
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