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菌株鉴定方法大PK,孰强孰弱?

2023-9-7 12:44| 发布者: 朱迪| 查看: 53| 评论: 0

摘要: 随着生物材料的广泛研发和应用,菌株的鉴定检测成为质量控制和功能筛选的重要环节。本期实验菌将为大家深入介绍适用于生物材料领域的主要菌株鉴定方法以及各种方法的优缺点,希望通过本文让大家对菌株鉴定和相关技术 ...


随着生物材料的广泛研发和应用,菌株的鉴定检测成为质量控制和功能筛选的重要环节。本期实验菌将为大家深入介绍适用于生物材料领域的主要菌株鉴定方法以及各种方法的优缺点希望通过本文让大家对菌株鉴定和相关技术有一个更加全面的认知!

一、菌株鉴定的重要性

微生物污染是影响生物材料质量和功能的主要因素。正确鉴定材料中的微生物菌株,对实现生物材料产品的质量控制和功能筛选意义重大。与化学污染不同,微生物污染可能持续增长并影响材料的性能

生物材料的研发和应用过程中,需要对原材料、中间品和产品进行微生物检测,特别是常见的真菌和细菌。采用不同的菌株鉴定方法不仅可以监测产品的微生物污染情况,还可用于筛选对材料功能有益的微生物菌株

二、菌株鉴定方法

用于生物材料领域的菌株鉴定方法有多种,本文将着重介绍几种常用的方法,具体如下:

1.革兰氏染色法

革兰氏染色结合显微镜观察是最基本的菌株鉴定技术。该方法首先进行革兰氏染色,然后通过显微镜观察菌落形态和菌体的格兰氏染色情况,根据颜色和形态进行初步鉴定。该方法成本低,操作简便可用于生物材料中菌株的初步筛查。但依赖于观察者的经验结果主观性较大

2.生化鉴定

生化鉴定是通过检测不同菌株对碳水化合物、氨基酸等底物利用能力的差异,结合菌落形态实现菌株分类鉴定。该方法操作简单结果较为可靠可区分大多数常见菌属。市售的生化鉴定系统如API测试牌可实现标准化操作但需要一定的培养时间,结果只能达到区分菌属的程度。

3.PCR鉴定

PCR技术的应用大大提高了菌株鉴定的特异性和敏感度。采用通用引物可扩增所有细菌的保守基因片段16S rDNA,序列比对分析可达到种或属鉴定。采用特异引物仅可检测目标菌实时荧光PCR可进行菌株的快速定量PCR反应条件需要经过优化,存在一定的假阴性结果

4.MALDI-TOF MS

MALDI-TOF质谱技术测定不同菌株的蛋白质组成指纹图谱,并在数据库中查询相匹配的已知菌株,从而实现快速准确的菌种鉴定。该技术操作简便高效,结果准确性高,成本也较为合理是目前应用广泛的菌株鉴定技术之一。但其数据库的质量对结果准确率有重要影响。

5.微生物基因组学分析

采用高通量测序技术对菌株进行全基因组或全基因组测序,可获得菌株的详尽遗传信息,并进行生物信息学分析,实现对未知菌株的准确鉴定。这种方法是实现精确鉴定的重要技术手段但需要进行复杂的生物信息学分析成本也较高

综合以上方法的优缺点,不同菌株鉴定技术之间主要存在以下区别:

1鉴定分辨率不同,从属鉴定到株鉴定的精确度不同;

2操作难易程度不同,有简便快速的,也有复杂耗时的;

3所需仪器设备不同,部分方法需要昂贵仪器;

4结果判读标准差异,是否需要后期生物信息分析。

对于基础科研来说,选择菌株鉴定技术时需要考虑精度度、通用性、信息量、运行成本、工作量以及结果解读等条件。综合考虑,初筛可用简便方法确证鉴定建议采用MALDI-TOF MS或基因组测序技术可以获得准确和丰富的菌株信息,满足基础科研对菌株鉴定的要求

四、小结

根据生物材料质量控制和功能筛选的不同需求,可选择采用简便的初筛方法,也可以使用精确的确证鉴定技术,开展菌株的检测与鉴定工作。了解各种菌株鉴定技术的优缺点可以更好地根据实际情况选择和运用合适的鉴定方法。如有需求也可直接联系指南针相关工作人员进行咨询和服务~


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