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截至2021年8月20日,WHO公布的“关切变异株”(VOCs)包括4种(Alpha, Beta, Gamma和Delta),其中VOC/Delta在全球范围内占主导地位,对传播性、临床严重程度和免疫逃逸影响较大。“关注变异株”(VOIs)也包括4种(Eta, Lota, Kappa和Lambda),其中由于Lambda变异株的传播性明显增强,并可能与南美洲一些国家新冠肺炎病死率增加有关,因此引起了极大的关注。
Lambda变异株刺突蛋白突变 与2020年初的野生型新冠病毒株相比,Lambda变异株刺突蛋白中的突变包括N端结构域(NTD)的缺失(Δ246-252),NTD的G75V和T76I突变,受体结合基序(RBM)的L452Q和F490S突变,融合肽(FP)和七肽重复序列1 (HR1)之间的T859N突变(图1)。
SARS-CoV-2 Lambda变异株的时空传播 截至2021年7月底,来自南美洲的阿根廷、巴西、智利、哥伦比亚、厄瓜多尔、秘鲁、乌拉圭,以及来自澳大利亚、比利时、加拿大、哥斯达黎加、丹麦、法国、德国、爱尔兰、意大利、日本、墨西哥、荷兰、西班牙、瑞典、瑞士、英国和美国均报告发现Lambda变异株。但大多数病例集中在南美洲。
Lambda变异株于2020年12月在秘鲁首次出现,大约在1.5~2个月后,Lambda变异株便成为秘鲁的优势毒株。5月中下旬,Lambda变异株序列占比达到峰值,6月和7月略降至80%左右。秘鲁两个相邻的国家——阿根廷(2.78%)和智利(3.75%),在2021年1月底报告了Lambda变异株。与秘鲁不同,Lambda变异株在这两个国家的传播明显缓慢。截至3月底,Lambda变异株在阿根廷新冠毒株比例一直保持在较低比例(<5%),5月17日上升至17.17%,6月和7月达到最高水平。而智利Lambda变异株的比例自3月初以来显著上升,4月中后期达到峰值,之后略有下降。厄瓜多尔从4月中后期开始报告Lambda 变异株,比例在5月份下降,在6、7月份恢复到与4月份相似的水平。随后,巴西、哥伦比亚和乌拉圭也陆续报告了Lambda变异株,但在这三个国家的流行率处于非常低的水平。除秘鲁外,Gamma变异株是目前南美洲许多国家的主要毒株。Lambda变异株与常见流行病学指标的相关性
2021年1月以来,秘鲁每百万新增病例数和新增死亡数明显增加,于2月和5月达到高水平,从6月开始下降,这与Lambda变异株序列比例的变化相似。阿根廷的每百万新增病例数和新增死亡数从3月下旬开始增加,4月下旬至6月下旬保持在高水平,智利的每百万新增病例数和新增死亡数从3月初开始增加,3月下旬至7月初保持高水平。阿根廷和智利每百万新增病例数高于秘鲁,而每百万新增死亡病例数则较低。
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