Int J Antimicrob Agents.：新建院区应用基因组追踪和精准感控肺炎克雷伯菌的传播:
目的： 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 (CRKP) 构成新的临床威胁。我们调查了它在一家新医院的引入和传播，评估了全基因组测序（WGS）作为感染控制措施的效果。方法： 基于已鉴定的肺炎克雷伯菌（Kpn）菌株的全基因组测序，对中国一家新建医院中CRKP的医院传播进行前瞻性分子流行病学研究。
结果： 2018年9月至2020年8月期间，从152名患者中分离出206株Kpn菌株，其中180株CRKP。首例输入病例和院内传播病例分别记录于2018年12月和2019年4月。总体而言，确定了22个涉及85名患者的院内传播聚集性病例，其中5个是由5-18名患者组成的大型聚集性病例。与小型集群相比，大型集群的索引病例更有可能与较低的格拉斯哥昏迷量表评分相关。此外，多变量逻辑回归结果表明，Kpn 在 ICU 患者[调整优势比 (aOR) = 4.96，95% 置信区间 (CI) 1.97-13.47] 和感染 ST11 菌株的患者 (aOR = 8.04, 95% CI 2.51-29.53) 或四环素耐药菌株 (aOR = 17.63, 95% CI 6. 32-57.32）。然而，在携带 rmpA 基因的菌株中，传播的可能性较小（aOR = 0.12，95% CI 0.03-0.37）。通过基于WGS的感染控制干预，院内CRKP病例率下降了2.25。
结论： 新建医院Kpn传播来源于多起境外输入病例。通过精确的感染控制措施，院内 CRKP 感染率大大降低。
该论文在新建医院进行肺炎克雷伯菌的全基因组测序监测，一旦发现院内超级细菌的传播，立即启动集束化（Bundle）干预措施进行对超级细菌的捕捉与控制。这篇论文首次评估干预前后精准感控措施的效果，对后续院内感染防控的监测提供了更精确的监测手段和防控手段。
Int J Antimicrob Agents. 2023 Sep;62(3):106910. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2023.106910.
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