【感染科普笔记2024-1-31】探秘病原微生物专栏丨同源性技术和临床微生物学三大作用
作者：宁永忠/温海楠审校：蓝雪0816
同源性这个词，在非生物医学领域也有应用，比如互联网技术。但百度词条里，只有生物学含义。截屏如下：
需要明确的是，这里仅仅提到氨基酸序列。事实上实际的生物学领域，核酸序列更常用。
我们再看看术语在线。术语在线收录了10个解释。前面4个如下：
这里明确写了核苷酸序列和氨基酸序列。也写了进化。临床微生物学领域，也用到这个概念和对应的技术，就是微生物株（如细菌菌株，或真菌菌株，或病毒株）之间的亲缘关系、微生物株核酸之间的相似程度——一致性。
我们看三个临床场景：场景A：某患者出现了尿路感染，确定病原是大肠埃希菌。医生可能会问，他的呼吸道、消化道都有这个菌种的菌株，尿路感染这一株大肠埃希菌与呼吸道、消化道菌株一样吗？场景B：某呼吸科病房01房间p1患者，确诊铜绿假单胞菌肺炎。该病房05房间p2患者，第二天也确诊了铜绿假单胞菌肺炎。医生可能会问，这两个铜绿假单胞菌有关吗？场景C：某心血管科病房，一般情况下肺炎罕见。某月，先后出现3例肺炎克雷伯菌肺炎。医生一定会问，是医院感染暴发了吗？
这些问题本质上都是微生物株之间的同源性问题，即它们彼此之间是否有同源性。由此，有必要强调一下临床微生物学三大作用，因为实践中仍然存在各种混乱或不知晓。三大（主要）作用包括：
[*]辅助诊断，对应培养、分离、鉴定技术，或抗原、抗体、核酸等检测；
[*]辅助治疗，对应药敏试验，治疗药物监测；
[*]对医院感控提供技术支持。
其中第三个作用“感控技术支持”，除了确定病原（这和作用1一样）外，就是确定感染源、途径、菌株同源性、是否暴发。这些问题在本质上都是同源性问题。
注意，这只是主要作用（“大”），不包括辅助临床流行病学等小的作用，并且只是微生物学的“临床”作用（所以叫临床微生物学），不包括基础医学微生物学的作用。后者最重要的是，对患者感染部位新出现的分离株，从学术角度，判断是否是病原。兹不赘述。
同源性技术主要包括表型技术和基于核酸的技术。
[*]表型技术：如底物反应谱，抗生素谱（antibiogram，这个词国内很多翻译为药物的活性谱、杀菌谱/抑菌谱，这是错误的）。
[*]核酸技术：如质粒分型（临床罕用）、电泳技术、测序技术（应用渐多，也是国际热点）等。
限于篇幅，这里仅介绍表型技术。对于同源性判断，临床微生物学领域的表型技术有2个：
[*]底物反应谱：大家日常鉴定用的设备，如梅里埃公司、BD公司、安图公司的仪器，反应卡里都有多个化学反应。这些化学反应的结果，简单看，就是多个阴性、阳性（和弱阳性）。这多个阴性、阳性的排列组合，就是底物反应谱。如果反应足够多（比如几十个），同源性菌株的底物反应谱会相同，非同源性菌株则会有几个不同。
[*]抗生素谱（antibiogram）：即一株菌对哪些药敏感，对哪些药耐药，就是药敏试验结果。抗生素谱这个概念是一个菌对多种药，而药物的活性谱、杀菌谱、抑菌谱则是一种抗菌药物对多种细菌菌。当试验药物种类足够多时，同源性菌株的药敏试验结果会相同，非同源性菌株的药敏试验结果则会有几个不同。
图片来自网络，侵删
表型技术的细节和国际实际应用的案例在此不展开讨论了，有兴趣者可阅读《感染性疾病的理念》（第二版，化工出版社）等书。
临床医生遇到上面的场景A、B、C，先看看两个菌的底物反应谱、药敏谱，彼此一样不一样。如果一样，则进一步作核酸等检测。因为宏观上明确区分彼此不太容易，而且对于特别耐药的菌株，抗生素谱就“失灵”了。或者某些菌种敏感抗菌药物种类少，如嗜麦芽窄食单胞菌，此时抗生素谱也没法儿应用。而且表型方法可以粗筛，不能确定，国际上目前以核酸序列为准；如果不一样，且较多不同，那可以说明不是同一株菌。
作为临床微生物学专业、临床感染病专业、感控专业，需要知道临床微生物学三大作用，尤其是感控技术支持的作用。并知晓其含义、技术、应用等。感染病诊断管理和抗生素合理应用管理中，不充分发挥临床微生物学的作用，不会达到最高境界。这是感染相关专业人员需要知晓乃至警醒的。
相关阅读
探秘病原微生物专栏丨微生物、病原微生物、微生物学、临床微生物学和公共卫生微生物学.
探秘病原微生物专栏丨感染和感染性疾病、传染和传染病.
探秘病原微生物专栏丨关于微生物学分类和范畴的说明.
探秘病原微生物专栏丨金黄色葡萄球菌.
探秘病原微生物专栏丨病原微生物的毒力和致病性.
探秘病原微生物专栏丨感染性疾病的诊断和病原学诊断.
探秘病原微生物专栏丨化脓链球菌.
探秘病原微生物专栏丨感染性疾病的临床处置.
探秘病原微生物专栏丨单核细胞增生李斯特菌.
探秘病原微生物专栏丨【生活篇】——感染性疾病的预防和控制.
探秘病原微生物专栏丨无乳链球菌.
探秘病原微生物专栏丨【医院篇】——感染性疾病的预防和控制(上).探秘病原微生物专栏丨【医院篇】——感染性疾病的预防和控制(下).探秘病原微生物专栏丨探秘病原微生物专栏丨临床微生物学助力精准感控——同源性技术
探秘病原微生物专栏丨产气荚膜梭菌.
探秘病原微生物专栏丨微生物感染的风险因素.
探秘病原微生物专栏丨探秘病原微生物专栏丨论微生物检验的样本和标本.
探秘病原微生物专栏丨样本学及样本相关难题.
探秘病原微生物专栏丨聊聊临床微生物学里的血液样本.探秘病原微生物专栏丨端午咸蛋话“沙门”.探秘病原微生物专栏丨探秘病原微生物丨此马非彼马——“马儿”与“马拉”如何区别？探秘病原微生物专栏丨血培养要关注曲霉菌吗？探秘病原微生物专栏丨捉“虫”计——解码肺孢子菌.探秘病原微生物专栏丨持续咳嗽数月-百日咳知多少？探秘病原微生物专栏丨临床微生物实验室如何有效防污染.探秘病原微生物专栏丨擦肩，但不能错过——谈厌氧培养的必要性.
探秘病原微生物专栏丨大师兄，师父被二师兄咬了！
探秘病原微生物专栏丨超级细菌知多少?---走近CRE.
探秘病原微生物专栏丨带您了解生物安全柜.
探秘病原微生物专栏丨不耐“色”的淋病奈瑟菌.
探秘病原微生物专栏丨大海里不仅有海鲜！ ——炎炎夏日嬉海踏浪慎防海洋刺客.
探秘病原微生物专栏丨L型细菌那些事儿.
探秘病原微生物专栏丨 脓肿分枝杆菌—抗生素的噩梦.
探秘病原微生物专栏丨撸猫撸狗要小心——多杀巴斯德菌可不是闹着玩的！探秘病原微生物专栏丨厌氧培养，难么？探秘病原微生物专栏丨还“懒汉病”一个真相！探秘病原微生物专栏丨脆弱拟杆菌，脆弱吗？探秘病原微生物专栏丨别有洞天—1例隐球菌肺部感染引发的微生物学反思.探秘病原微生物专栏丨艰难拟梭菌的艰难之旅.
探秘病原微生物专栏丨肺炎支原体那些事儿！
探秘病原微生物专栏丨冰箱杀手-单核细胞增生李斯特菌血流感染1例.
探秘病原微生物专栏丨“痘痘菌”之痤疮皮肤杆菌.
欢迎投稿：sific2007@163.com“本平台所有文章欢迎大家转发到朋友圈、群内学习，但若需转载至公众号或其它平台发布，请先联系小编确认同意”图文：王小虾
本文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/bMzfYrX4_UyO_Jx_v-8wbA
点分享
点收藏
点在看
点点赞
谢谢老师分享，从中学习了！ 谢谢老师分享，从中学习了！
页:
[1]