【感染科普笔记2023-4-26】吴凡丨以腹泻为例，聊聊特大型城市传染病综合监测
本帖最后由 wuxing718 于 2024-9-28 13:23 编辑吴凡丨以腹泻为例，聊聊特大型城市传染病综合监测
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原创 整理丨陈音汁 SIFIC感染科普笔记 2023-04-26 19:01 发表于内蒙古
讲者丨吴凡（复旦大学上海医学院）
整理丨陈音汁（重庆市人民医院）
审核丨王玉兰（佛山复星禅诚医院）
来源丨2022年SIFIC暨OCAMRI联合会议
如何及时发现各类腹泻病及变异株、新病原？如何揭示腹泻病全人群流行规律和趋势？如何医防融合、服务临床诊治？如何及早发现暴发疫情、精准溯源？复旦大学上海医学院的吴凡教授分享了《特大型城市腹泻病综合监测》，对构建特大型城市腹泻病综合监测创新体系，实现快、准、全的疾病检测体系，为腹泻以及其他类型传染病提供了前沿的思路和方法。
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一、腹泻病综合监测方法
腹泻病综合监测主要由三个模块组成：
流行病学研究：监测代表性，流行特征、病原谱变化规律。病例临床特诊；
病原监测鉴定研究：采样富集技术、多病原集成检测、分子分型溯源、耐药检测技术；
信息化及预警预测研究：基于HIS系统的智能插件研发、数据元标准制定、预警预测模型构建、智能辅助诊疗。
二、腹泻病综合监测意义
1. 建成全国首家省级腹泻病综合监测体系：通过本研究揭示了上海市腹泻病流行全貌（全年龄组、全时段、全病原），且样本量精准足量，采用多阶段分层PPS抽样和信息化辅助随机病例，通过病原样本全息全量、多病原组合检测等方法，还发现了多种新发、少见、罕见病原体。
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2. 揭示腹泻病流行规律、病原谱变化趋势和临床特征：腹泻病呈现冬夏双峰流行特征，病毒性腹泻占多数，而诺如病毒成为上海地区腹泻优势病原，细菌性腹泻则以空肠弯曲菌和致病性大肠杆菌为主，与发达国家相似，成人儿童腹泻病原谱差异大。并基于症状体征组合得到结论：
粪便形状：水样便＞稀软便＞粘液便
细菌体征：腹痛＞恶心＞呕吐、发热
病毒体征：腹痛、恶心＞呕吐＞发热
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3. 构建上海腹泻病症状监测基线实现预警预测：实现流病-临床-病原-药敏全信息闭环，使用机器学习辅助模型，人工智能建立基于监测病例全量数据，开展预警预测。
4. 建立基于症状的组合检测创新技术体系：基于症状的组合和检测创新体系，全面提升检测效率，揭示耐药谱动态变化趋势，辅助临床诊疗。通过本项目，发现上海地区二代、三代头孢类抗菌素耐药上升趋势，并发现全球首次对10种抗菌药物耐药的多重耐药菌黄褐假单胞菌，另外通过分子分型溯源技术和质谱鉴定技术的组合应用鉴定了全国首例肠出血大肠O104：H4血清及分子鉴定技术。
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5. 实现精准分子溯源，推动防控关口前移：建立全新的副溶血性弧菌大流行株双重PCR检测方法；首批、最早建立基于PEGE、二代测序技术的实验室网络。还可以发现散在关联病例，实现暴发疫情的精准溯源，通过食品、病例等不同来源标本，开展精准分子溯源，发现跨地区的聚集性疫情，锁定源头污染食品。
6. 利用信息技术构建流病-临床-病原多源大数据平台：建立腹泻病信息标准，制定腹泻病综合监测功能规范，研发基于HIS系统的智能插件，医生工作站，构建智能化辅助诊疗方法。
三、腹泻病综合监测成效
1. 腹泻病综合监测直接成效：
（1）阐明特大型城市腹泻病全貌；
（2）构建流病-临床-病原大数据基线；
（3）构建多病原集成检测技术体系及创新技术；
（4）发明、建立全新大流行株双重PCR检测方法；
（5）构建信息标准，形成流病-临床诊断-病原检测信息闭环。
2. 另外还有实践应用：
（1）优化技术规范；
（2）调整防控政策；
（3）形成技术及体系；
（4）全市医疗机构应用；
（5）监测报告作为防控决策证据；
（6）耐药简报成为医院诊疗依据。
3. 效应与影响：
（1）创新传染病综合监测模式在全国示范引领；
（2）为传染病综合监测体系构建理论和逻辑框架；
（3）为新冠防控、上海经验奠定基础模式；
（4）建立快、准、全的病原鉴定和溯源技术体系；
（5）形成症状-病原-耐药-诊治的医防融合的闭环；
（6）建立信息标准，利用信息技术构建大数据平台。
4. 腹泻病监测体系形成整个闭环管理：
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完善的监测体系需要医疗卫生机构的积极配合；需要卫生行政部门的大力支持，还有配套资金的支持。
感 想
以腹泻病为例，吴教授提示了大数据如何实现特大型城市传染病综合监测，为其他传染病防控管理提供思路和奠定基础，构建了理论和逻辑的框架，形成了大数据医防结合的平台，值得全国其他城市学习。
封面图片来自网络
图文：王小虾 值得学习参考的案例
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