循证资讯之RT-PCR 检测 SARS-COV-2 不同采样方法的诊断准确性
本帖最后由 小白天使 于 2021-11-25 08:32 编辑RT-PCR 检测 SARS-COV-2 不同采样方法的诊断准确性：一个系统评价和荟萃分析 https://mp.weixin.qq.com/s/UtwUZxjxBxg247wX01qPZg原创 朱迪 SIFIC感染循证资讯 编译：朱迪
研究背景
#为 SARS - CoV - 2 感染进行准确和有效的诊断，在临床和公共卫生领域是一个需要解决的问题。虽然有几项研究通过 RT-PCR 比较了使用不同呼吸道标本检测 SARS - CoV - 2 的准确性，但在疑似感染人群中不同临床取样方法的比较性能仍不清楚。
#2021 年 2 月 20 日，使用描述 SARS - CoV - 2 感染和不同呼吸道标本的搜索词，且不限定语言，确定了 10 篇关于该问题的评论。其中 5 篇综述只包括对确诊的 covid-19 患者的研究，仅报道了感染者中不同呼吸道标本的阳性率一致。
由于在这些研究中没有未受感染的参与者，它们在评估以假阳性或阴性预测价值识别或排除疑似感染个体的疾病的诊断性能方面没有帮助。
其他五篇综述只检查了唾液与鼻咽拭子相比的性能，而不是对所有常用的采样方法进行了全面的比较。没有审查检查混合鼻部咽喉部拭子、鼻拭子或咽拭子的性能，或报告不同采样方法的阳性和阴性预测值，这两个指标对于从患者和医疗工作者的角度理解检测结果的含义是必要的。
此外，没有一项综述比较了由医疗工作者采集样本和通过自我采集样本是否有差别。
#目前，使用 RT - PCR 检测诊断疑似感染人群是否感染 SARS - CoV - 2 有不同的采样方法，这些采样方法的比较结果尚不明确。本荟萃分析旨在系统比较不同临床标本采集方法的诊断效能。
方法
在本系统综述和荟萃分析中，我们系统地搜索了 2000 年 1 月 1 日至 2020 年 11 月 16 日的 PubMed, Embase, MEDLINE, Web of Science, medRxiv, bioRxiv, SSRN, 和 Research Square。
纳入的研究为门诊护理中用鼻咽拭子采样以及任何其他呼吸标本用来检查诊断 SARS - CoV - 2 感染的原始临床研究。没有配对样本数据的研究，以及为检验测试的诊断效能而从确诊 SARS - CoV - 2 病例中获得的不同样本数据的研究被排除在外。
采用随机效应模型和双弧线变换检测诊断性能，包括敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值。
结果
在我们的搜索中确定的 5577 项研究中，其中 23 项研究中包括 7973 名参与者的 16 762 个呼吸道样本。这些研究中检查的呼吸道标本包括 7973 份鼻咽拭子、1622 份鼻拭子、6110 份唾液样本、338 份咽喉拭子和 719 份混合的鼻拭子和咽喉拭子。
以鼻咽拭子为金标准，混合的鼻部和咽喉拭子的敏感性最高，为 97%（95% CI 93-100），而唾液（85%，75-93）和鼻拭子（86%，77-93）要低一些，咽喉拭子的敏感性则要低得多（68%，35-94）。
通过混合的鼻部和咽喉部拭子（97%，90-100）和鼻拭子（96%，87-100）获得了相对较高的阳性预测值，而唾液的阳性预测值略低（93%，88-97）。
咽拭子的阳性预测值最低，为 75%（95%ci45-96）。在不同的临床标本中观察到相对较高的特异性（范围 97-99%）和阴性预测值（范围 95-99%）。
比较医疗工作者采集和自我采集的混合鼻部咽部拭子和鼻拭子显示诊断效能无差异。在混合鼻部咽喉部拭子和咽拭子的分析中没有观察到显著的差异，而在唾液和鼻拭子的收集中有中度到实质性的异质性 (I2≥30%)。
结论
我们的综述表明，在门诊护理，与鼻咽拭子的金标准相比，作为可替代标本采集方法混合的鼻部咽部拭子为诊断 SARS - CoV - 2 感染的提供了最佳的诊断性能。唾液和鼻拭子具有可比性和非常好的诊断性能，是临床可接受的替代标本采集方法。咽喉部拭子的敏感性和阳性预测值要低得多，则不被推荐。
自我采集的标本包括混合的鼻部咽喉部拭子和鼻拭子不会影响到诊断准确性。我们的研究结果为正确解释使用不同临床样本的 SARS - CoV - 2 检测结果提供了一个有用的参考框架。
基金
香港研究资助委员会。
本研究的附加值
为了填补这一研究空白，我们对不同临床取样方法检测 SARS - CoV - 2 的研究进行了系统回顾和荟萃分析。我们系统地搜索了 2000 年 1 月 1 日至 2020 年 11 月 16 日的 PubMed, Embase, MEDLINE, Web of Science, medRxiv, bioRxiv, SSRN, 和 Research Square。
我们纳入了原始的临床研究，检查门诊护理的个体中鼻咽拭子和任何其他呼吸道标本用来诊断在的 SARS - CoV - 2 感染的检验效能。使用随机效应模型和双弧线变换检查了诊断性能，包括敏感性、特异性、阳性预测值和阴性预测值。
据我们所知，这是第一个系统的回顾和荟萃分析，检查不同临床抽样方法对 SARS - CoV - 2 检测的比较诊断效能，并评估敏感性、特异性、阳性预测价值和阴性预测价值。
我们的综述表明，与鼻咽拭子的金标准相比，混合的鼻部咽喉部拭子提供了最佳的诊断效能，并代表了最佳的替代取样方法。唾液和鼻拭子也具有非常好的和可比性的性能，是临床可接受的替代标本收集方法，以准确诊断 SARS - CoV - 2 感染。对于所有这三种方法，自我采集这些临床标本不会影响到诊断准确性。
所有现有证据的含义
我们的研究结果为正确解释使用不同临床标本的 SARS-CoV-2 检测结果提供了一个有用的参考框架。它们还支持使用混合的鼻部咽喉部拭子、唾液和鼻拭子作为 SARS-CoV-2RNA 检测的替代采样方法，并使用自我采集，以促进在适当的社区环境中有效地扩大检测规模。
文献来源：Diagnostic performance of different sampling approaches for SARS-CoV-2 RT-PCR testing: a systematic review and meta-analysis Nicole Ngai Yung Tsang, Hau Chi So, Ka Yan Ng, et al Lancet Infect Dis 2021; 21: 1233-1245 DOI:https://doi.org/10.1016/S1473-3099(21)00146-8
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