婴儿从出生到24周的肠道微生物群组成的演变
婴儿从出生到24周的肠道微生物群组成的演变血流感染细菌监测BRICS 2018-04-13作者 叶光勇-浙大妇院背景：肠道是人类微生物组学研究最广泛的领域。这项研究的目的是描述1至24周龄的母乳喂养婴儿（n = 192）的初始肠道微生物群发育情况。方法：对FT-SVD（足月顺产婴儿）、FT-CS（足月剖腹产婴儿）PT-SVD（早产顺产婴儿）、PT-CS（早产剖腹产婴儿）的粪便样品进行16S rRNA基因V4-V5区测序并行地进行细菌培养。通过LC-MS也检测了4周龄时婴儿尿液的代谢组学特征。结果：足月（FT）、自发性阴道分娩（SVD）婴儿的微生物群在所检查的24周期间在门和属水平都保持稳定。与FT-SVD婴儿相比，足月剖腹产（FT-CS）婴儿在生命的第一周后显示粪便厚壁菌丰度增加（p <0.01）和较低的放线菌数量（p <0.001）。 FT-CS婴儿逐渐发展到在第24周类似于FT-SVD第8周的微生物群。相比于FT婴儿，早产儿（PT）的肠道微生物群显示更多的变形菌门（p <0.001）。婴儿肠道菌群独特的代谢组图与肠道菌群的特征有关，足月分娩婴儿代谢差异不大，但是早产剖腹分娩婴儿与足月分娩产儿的代谢差异较明显。在第4周的代谢组分析显示PT-CS婴儿具有与FT（CS和SVD）婴儿功能不同的代谢物特征。辅助惯性分析显示婴儿尿代谢组和粪便微生物群之间存在共同变异。发现色氨酸和酪氨酸代谢途径以及脂肪酸和胆汁酸代谢受到递送模式和孕龄的影响。结论：这些发现证实了分娩方式和胎龄对早期新生儿微生物群的组成有重要影响。 FT和PT婴儿的代谢物特征也有显着差异。有趣的是，长期母乳喂养显示对24周龄FT-CS婴儿的微生物群组成有显着影响，但不在FT-SVD婴儿中。双胞胎的相似微生物群落多于两个随机婴儿，反映了宿主遗传学和环境对微生物群的相似性的影响。
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